Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA3

RUFY2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY2Q8WXA3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RUFY2Q8WXA3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RUFY2Q8WXA3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RUFY2Q8WXA3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RUFY2Q8WXA3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RUFY2Q8WXA3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RUFY2Q8WXA3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RUFY2Q8WXA3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RUFY2Q8WXA3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RUFY2Q8WXA3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RUFY2Q8WXA3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RUFY2Q8WXA3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RUFY2Q8WXA3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RUFY2Q8WXA3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RUFY2Q8WXA3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RUFY2Q8WXA3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RUFY2Q8WXA3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RUFY2Q8WXA3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RUFY2Q8WXA3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RUFY2Q8WXA3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RUFY2Q8WXA3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RUFY2Q8WXA3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RUFY2Q8WXA3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
RUFY2Q8WXA3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RUFY2Q8WXA3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RUFY2Q8WXA3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RUFY2Q8WXA3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RUFY2Q8WXA3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RUFY2Q8WXA3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RUFY2Q8WXA3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RUFY2Q8WXA3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RUFY2Q8WXA3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RUFY2Q8WXA3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RUFY2Q8WXA3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RUFY2Q8WXA3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RUFY2Q8WXA3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RUFY2Q8WXA3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RUFY2Q8WXA3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RUFY2Q8WXA3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RUFY2Q8WXA3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RUFY2Q8WXA3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RUFY2Q8WXA3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RUFY2Q8WXA3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RUFY2Q8WXA3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RUFY2Q8WXA3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RUFY2Q8WXA3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RUFY2Q8WXA3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RUFY2Q8WXA3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RUFY2Q8WXA3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RUFY2Q8WXA3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RUFY2Q8WXA3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RUFY2Q8WXA3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RUFY2Q8WXA3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RUFY2Q8WXA3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RUFY2Q8WXA3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RUFY2Q8WXA3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RUFY2Q8WXA3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RUFY2Q8WXA3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RUFY2Q8WXA3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RUFY2Q8WXA3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RUFY2Q8WXA3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RUFY2Q8WXA3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RUFY2Q8WXA3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RUFY2Q8WXA3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RUFY2Q8WXA3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RUFY2Q8WXA3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RUFY2Q8WXA3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
RUFY2Q8WXA3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
RUFY2Q8WXA3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
RUFY2Q8WXA3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RUFY2Q8WXA3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RUFY2Q8WXA3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RUFY2Q8WXA3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RUFY2Q8WXA3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RUFY2Q8WXA3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RUFY2Q8WXA3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
RUFY2Q8WXA3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RUFY2Q8WXA3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RUFY2Q8WXA3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RUFY2Q8WXA3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RUFY2Q8WXA3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RUFY2Q8WXA3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RUFY2Q8WXA3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RUFY2Q8WXA3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RUFY2Q8WXA3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RUFY2Q8WXA3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RUFY2Q8WXA3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RUFY2Q8WXA3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RUFY2Q8WXA3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RUFY2Q8WXA3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RUFY2Q8WXA3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RUFY2Q8WXA3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RUFY2Q8WXA3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RUFY2Q8WXA3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RUFY2Q8WXA3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RUFY2Q8WXA3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RUFY2Q8WXA3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RUFY2Q8WXA3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RUFY2Q8WXA3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RUFY2Q8WXA3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms