Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8U3

RTL3, Retrotransposon Gag-like protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL3Q8N8U3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RTL3Q8N8U3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RTL3Q8N8U3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RTL3Q8N8U3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RTL3Q8N8U3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RTL3Q8N8U3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RTL3Q8N8U3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RTL3Q8N8U3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RTL3Q8N8U3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RTL3Q8N8U3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RTL3Q8N8U3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RTL3Q8N8U3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RTL3Q8N8U3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RTL3Q8N8U3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RTL3Q8N8U3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RTL3Q8N8U3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RTL3Q8N8U3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RTL3Q8N8U3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RTL3Q8N8U3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RTL3Q8N8U3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RTL3Q8N8U3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RTL3Q8N8U3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RTL3Q8N8U3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RTL3Q8N8U3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RTL3Q8N8U3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RTL3Q8N8U3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RTL3Q8N8U3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RTL3Q8N8U3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RTL3Q8N8U3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RTL3Q8N8U3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RTL3Q8N8U3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RTL3Q8N8U3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RTL3Q8N8U3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RTL3Q8N8U3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RTL3Q8N8U3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RTL3Q8N8U3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RTL3Q8N8U3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RTL3Q8N8U3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RTL3Q8N8U3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RTL3Q8N8U3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RTL3Q8N8U3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RTL3Q8N8U3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RTL3Q8N8U3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RTL3Q8N8U3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RTL3Q8N8U3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RTL3Q8N8U3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RTL3Q8N8U3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RTL3Q8N8U3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RTL3Q8N8U3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RTL3Q8N8U3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RTL3Q8N8U3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RTL3Q8N8U3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RTL3Q8N8U3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RTL3Q8N8U3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RTL3Q8N8U3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RTL3Q8N8U3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RTL3Q8N8U3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RTL3Q8N8U3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RTL3Q8N8U3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RTL3Q8N8U3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RTL3Q8N8U3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RTL3Q8N8U3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RTL3Q8N8U3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RTL3Q8N8U3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RTL3Q8N8U3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RTL3Q8N8U3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
RTL3Q8N8U3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RTL3Q8N8U3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RTL3Q8N8U3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
RTL3Q8N8U3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RTL3Q8N8U3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RTL3Q8N8U3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RTL3Q8N8U3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RTL3Q8N8U3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RTL3Q8N8U3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RTL3Q8N8U3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RTL3Q8N8U3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RTL3Q8N8U3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RTL3Q8N8U3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RTL3Q8N8U3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RTL3Q8N8U3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RTL3Q8N8U3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RTL3Q8N8U3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RTL3Q8N8U3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RTL3Q8N8U3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RTL3Q8N8U3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RTL3Q8N8U3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RTL3Q8N8U3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RTL3Q8N8U3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RTL3Q8N8U3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RTL3Q8N8U3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RTL3Q8N8U3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RTL3Q8N8U3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RTL3Q8N8U3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RTL3Q8N8U3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RTL3Q8N8U3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RTL3Q8N8U3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RTL3Q8N8U3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RTL3Q8N8U3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RTL3Q8N8U3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms