Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Y2

LRRC17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC17Q8N6Y2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRRC17Q8N6Y2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRRC17Q8N6Y2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRRC17Q8N6Y2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRRC17Q8N6Y2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRRC17Q8N6Y2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRRC17Q8N6Y2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRRC17Q8N6Y2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
LRRC17Q8N6Y2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRRC17Q8N6Y2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRRC17Q8N6Y2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRRC17Q8N6Y2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRRC17Q8N6Y2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRRC17Q8N6Y2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRRC17Q8N6Y2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRRC17Q8N6Y2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRRC17Q8N6Y2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRRC17Q8N6Y2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRRC17Q8N6Y2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRRC17Q8N6Y2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRRC17Q8N6Y2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRRC17Q8N6Y2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRRC17Q8N6Y2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRRC17Q8N6Y2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRRC17Q8N6Y2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRRC17Q8N6Y2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRRC17Q8N6Y2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LRRC17Q8N6Y2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LRRC17Q8N6Y2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRRC17Q8N6Y2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRRC17Q8N6Y2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRRC17Q8N6Y2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRRC17Q8N6Y2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRRC17Q8N6Y2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRRC17Q8N6Y2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRRC17Q8N6Y2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRRC17Q8N6Y2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRRC17Q8N6Y2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRRC17Q8N6Y2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRRC17Q8N6Y2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRRC17Q8N6Y2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRRC17Q8N6Y2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRRC17Q8N6Y2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRRC17Q8N6Y2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRRC17Q8N6Y2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRRC17Q8N6Y2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRRC17Q8N6Y2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LRRC17Q8N6Y2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRC17Q8N6Y2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRC17Q8N6Y2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRC17Q8N6Y2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRC17Q8N6Y2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRC17Q8N6Y2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRC17Q8N6Y2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRC17Q8N6Y2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRC17Q8N6Y2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRC17Q8N6Y2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRC17Q8N6Y2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRC17Q8N6Y2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRC17Q8N6Y2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRC17Q8N6Y2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRC17Q8N6Y2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRC17Q8N6Y2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRC17Q8N6Y2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRC17Q8N6Y2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRC17Q8N6Y2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRC17Q8N6Y2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRC17Q8N6Y2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRC17Q8N6Y2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRC17Q8N6Y2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRC17Q8N6Y2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRC17Q8N6Y2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRC17Q8N6Y2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRC17Q8N6Y2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRRC17Q8N6Y2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRRC17Q8N6Y2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRRC17Q8N6Y2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRRC17Q8N6Y2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRRC17Q8N6Y2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRRC17Q8N6Y2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRRC17Q8N6Y2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRRC17Q8N6Y2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
LRRC17Q8N6Y2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRRC17Q8N6Y2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRRC17Q8N6Y2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
LRRC17Q8N6Y2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRRC17Q8N6Y2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRRC17Q8N6Y2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRRC17Q8N6Y2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRRC17Q8N6Y2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRRC17Q8N6Y2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LRRC17Q8N6Y2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LRRC17Q8N6Y2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LRRC17Q8N6Y2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LRRC17Q8N6Y2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LRRC17Q8N6Y2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LRRC17Q8N6Y2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LRRC17Q8N6Y2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LRRC17Q8N6Y2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
LRRC17Q8N6Y2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.6 ms