Protein–RNA interactions for Protein: Q86YH6

PDSS2, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS2Q86YH6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDSS2Q86YH6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDSS2Q86YH6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PDSS2Q86YH6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDSS2Q86YH6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDSS2Q86YH6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDSS2Q86YH6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDSS2Q86YH6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDSS2Q86YH6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDSS2Q86YH6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDSS2Q86YH6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDSS2Q86YH6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDSS2Q86YH6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PDSS2Q86YH6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDSS2Q86YH6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDSS2Q86YH6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDSS2Q86YH6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDSS2Q86YH6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDSS2Q86YH6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDSS2Q86YH6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDSS2Q86YH6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDSS2Q86YH6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDSS2Q86YH6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDSS2Q86YH6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDSS2Q86YH6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDSS2Q86YH6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDSS2Q86YH6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDSS2Q86YH6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDSS2Q86YH6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDSS2Q86YH6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDSS2Q86YH6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDSS2Q86YH6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDSS2Q86YH6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDSS2Q86YH6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDSS2Q86YH6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDSS2Q86YH6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDSS2Q86YH6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDSS2Q86YH6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDSS2Q86YH6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDSS2Q86YH6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDSS2Q86YH6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDSS2Q86YH6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDSS2Q86YH6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDSS2Q86YH6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDSS2Q86YH6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDSS2Q86YH6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDSS2Q86YH6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDSS2Q86YH6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PDSS2Q86YH6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDSS2Q86YH6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDSS2Q86YH6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDSS2Q86YH6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDSS2Q86YH6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDSS2Q86YH6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDSS2Q86YH6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDSS2Q86YH6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDSS2Q86YH6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDSS2Q86YH6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDSS2Q86YH6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDSS2Q86YH6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PDSS2Q86YH6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDSS2Q86YH6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDSS2Q86YH6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDSS2Q86YH6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDSS2Q86YH6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDSS2Q86YH6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDSS2Q86YH6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDSS2Q86YH6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDSS2Q86YH6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDSS2Q86YH6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDSS2Q86YH6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PDSS2Q86YH6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDSS2Q86YH6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDSS2Q86YH6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDSS2Q86YH6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDSS2Q86YH6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDSS2Q86YH6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDSS2Q86YH6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDSS2Q86YH6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDSS2Q86YH6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PDSS2Q86YH6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDSS2Q86YH6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDSS2Q86YH6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDSS2Q86YH6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDSS2Q86YH6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDSS2Q86YH6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDSS2Q86YH6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDSS2Q86YH6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDSS2Q86YH6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDSS2Q86YH6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDSS2Q86YH6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PDSS2Q86YH6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDSS2Q86YH6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDSS2Q86YH6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDSS2Q86YH6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDSS2Q86YH6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDSS2Q86YH6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDSS2Q86YH6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDSS2Q86YH6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDSS2Q86YH6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms