Protein–RNA interactions for Protein: Q7LBR1

CHMP1B, Charged multivesicular body protein 1b, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP1BQ7LBR1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHMP1BQ7LBR1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHMP1BQ7LBR1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHMP1BQ7LBR1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHMP1BQ7LBR1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CHMP1BQ7LBR1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHMP1BQ7LBR1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHMP1BQ7LBR1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHMP1BQ7LBR1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHMP1BQ7LBR1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHMP1BQ7LBR1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHMP1BQ7LBR1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHMP1BQ7LBR1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHMP1BQ7LBR1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHMP1BQ7LBR1 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHMP1BQ7LBR1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHMP1BQ7LBR1 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHMP1BQ7LBR1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHMP1BQ7LBR1 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHMP1BQ7LBR1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CHMP1BQ7LBR1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHMP1BQ7LBR1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHMP1BQ7LBR1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHMP1BQ7LBR1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHMP1BQ7LBR1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHMP1BQ7LBR1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHMP1BQ7LBR1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHMP1BQ7LBR1 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHMP1BQ7LBR1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHMP1BQ7LBR1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHMP1BQ7LBR1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHMP1BQ7LBR1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHMP1BQ7LBR1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHMP1BQ7LBR1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHMP1BQ7LBR1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CHMP1BQ7LBR1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHMP1BQ7LBR1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CHMP1BQ7LBR1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CHMP1BQ7LBR1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHMP1BQ7LBR1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHMP1BQ7LBR1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHMP1BQ7LBR1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHMP1BQ7LBR1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHMP1BQ7LBR1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHMP1BQ7LBR1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHMP1BQ7LBR1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHMP1BQ7LBR1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHMP1BQ7LBR1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHMP1BQ7LBR1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHMP1BQ7LBR1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHMP1BQ7LBR1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHMP1BQ7LBR1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CHMP1BQ7LBR1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CHMP1BQ7LBR1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CHMP1BQ7LBR1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CHMP1BQ7LBR1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHMP1BQ7LBR1 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHMP1BQ7LBR1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHMP1BQ7LBR1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHMP1BQ7LBR1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHMP1BQ7LBR1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHMP1BQ7LBR1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHMP1BQ7LBR1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHMP1BQ7LBR1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHMP1BQ7LBR1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHMP1BQ7LBR1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHMP1BQ7LBR1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHMP1BQ7LBR1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHMP1BQ7LBR1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHMP1BQ7LBR1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHMP1BQ7LBR1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CHMP1BQ7LBR1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CHMP1BQ7LBR1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CHMP1BQ7LBR1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHMP1BQ7LBR1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHMP1BQ7LBR1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHMP1BQ7LBR1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHMP1BQ7LBR1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHMP1BQ7LBR1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHMP1BQ7LBR1 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHMP1BQ7LBR1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHMP1BQ7LBR1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHMP1BQ7LBR1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHMP1BQ7LBR1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHMP1BQ7LBR1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHMP1BQ7LBR1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHMP1BQ7LBR1 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHMP1BQ7LBR1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHMP1BQ7LBR1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHMP1BQ7LBR1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHMP1BQ7LBR1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHMP1BQ7LBR1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CHMP1BQ7LBR1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHMP1BQ7LBR1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHMP1BQ7LBR1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHMP1BQ7LBR1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHMP1BQ7LBR1 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHMP1BQ7LBR1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHMP1BQ7LBR1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHMP1BQ7LBR1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms