Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC2

LARP4, La-related protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP4Q71RC2 CTBP1-214ENST00000514495 564 ntTSL 225.2■■□□□ 1.629e-7■■■■■ 27.3
LARP4Q71RC2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.259e-7■■■■■ 27.3
LARP4Q71RC2 CTBP1-217ENST00000515399 985 ntTSL 318.04■□□□□ 0.489e-7■■■■■ 27.3
LARP4Q71RC2 CTBP1-208ENST00000506180 843 ntTSL 516.63■□□□□ 0.259e-7■■■■■ 27.3
LARP4Q71RC2 SCAF11-206ENST00000474828 757 ntTSL 215.78■□□□□ 0.129e-7■■■■■ 27.3
LARP4Q71RC2 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.049e-7■■■■■ 27.3
LARP4Q71RC2 CTBP1-213ENST00000514210 856 ntTSL 213.98□□□□□ -0.179e-7■■■■■ 27.3
LARP4Q71RC2 CTBP1-212ENST00000513420 704 ntTSL 313.38□□□□□ -0.279e-7■■■■■ 27.3
LARP4Q71RC2 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.449e-7■■■■■ 27.3
LARP4Q71RC2 SCAF11-201ENST00000266589 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 511.32□□□□□ -0.69e-7■■■■■ 27.3
LARP4Q71RC2 POP7-202ENST00000457480 483 ntTSL 313.66□□□□□ -0.225e-6■■■■■ 27.3
LARP4Q71RC2 ABHD14A-ACY1-215ENST00000636646 2151 ntTSL 522.82■■□□□ 1.244e-8■■■■■ 27.3
LARP4Q71RC2 ABHD14A-ACY1-212ENST00000636089 2230 ntTSL 522.55■■□□□ 1.24e-8■■■■■ 27.3
LARP4Q71RC2 ABHD14A-ACY1-201ENST00000463721 1836 ntTSL 221.62■■□□□ 1.054e-8■■■■■ 27.3
LARP4Q71RC2 ABHD14A-ACY1-226ENST00000637696 2373 ntTSL 521.15■□□□□ 0.984e-8■■■■■ 27.3
LARP4Q71RC2 ABHD14A-ACY1-208ENST00000635951 2168 ntTSL 519.78■□□□□ 0.764e-8■■■■■ 27.3
LARP4Q71RC2 ABHD14A-ACY1-217ENST00000636718 2499 ntTSL 519.61■□□□□ 0.734e-8■■■■■ 27.3
LARP4Q71RC2 ABHD14A-ACY1-207ENST00000635946 2459 ntTSL 519.05■□□□□ 0.644e-8■■■■■ 27.3
LARP4Q71RC2 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.584e-8■■■■■ 27.3
LARP4Q71RC2 ABHD14A-ACY1-220ENST00000637025 2926 ntTSL 517.54■□□□□ 0.44e-8■■■■■ 27.3
LARP4Q71RC2 ABHD14A-ACY1-218ENST00000636826 2940 ntTSL 517.14■□□□□ 0.334e-8■■■■■ 27.3
LARP4Q71RC2 ABHD14A-ACY1-221ENST00000637130 3158 ntTSL 516.23■□□□□ 0.194e-8■■■■■ 27.3
LARP4Q71RC2 ABHD14A-ACY1-227ENST00000637730 2735 ntTSL 515.01□□□□□ -0.014e-8■■■■■ 27.3
LARP4Q71RC2 ABHD14A-ACY1-224ENST00000637512 1536 ntTSL 514.31□□□□□ -0.124e-8■■■■■ 27.3
LARP4Q71RC2 ABHD14A-ACY1-228ENST00000637778 3628 ntTSL 514.21□□□□□ -0.134e-8■■■■■ 27.3
LARP4Q71RC2 ABHD14A-ACY1-214ENST00000636490 3067 ntTSL 513.91□□□□□ -0.184e-8■■■■■ 27.3
LARP4Q71RC2 TMX2-207ENST00000529403 1697 ntTSL 28.94□□□□□ -0.986e-8■■■■■ 27.3
LARP4Q71RC2 TMX2-202ENST00000378312 1521 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.186e-8■■■■■ 27.3
LARP4Q71RC2 TMX2-201ENST00000278422 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.246e-8■■■■■ 27.3
LARP4Q71RC2 LINC00534-204ENST00000524361 620 ntTSL 35.59□□□□□ -1.514e-7■■■■■ 27.3
LARP4Q71RC2 NDUFA7-202ENST00000593729 569 ntTSL 214.4□□□□□ -0.16e-11■■■■■ 27.3
LARP4Q71RC2 NDUFA7-204ENST00000601101 414 ntTSL 413.79□□□□□ -0.26e-11■■■■■ 27.3
LARP4Q71RC2 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.316e-11■■■■■ 27.3
LARP4Q71RC2 NDUFA7-206ENST00000602059 528 ntTSL 411.55□□□□□ -0.566e-11■■■■■ 27.3
LARP4Q71RC2 NDUFA7-201ENST00000301457 601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.646e-11■■■■■ 27.3
LARP4Q71RC2 NDUFA7-205ENST00000601258 547 ntTSL 29.74□□□□□ -0.856e-11■■■■■ 27.3
LARP4Q71RC2 NDUFA7-203ENST00000595856 553 ntTSL 59.22□□□□□ -0.936e-11■■■■■ 27.3
LARP4Q71RC2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.711e-6■■■■■ 27.2
LARP4Q71RC2 ATOX1-201ENST00000313115 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.981e-6■■■■■ 27.2
LARP4Q71RC2 ATOX1-204ENST00000522145 423 ntTSL 28.2□□□□□ -1.11e-6■■■■■ 27.2
LARP4Q71RC2 ATOX1-205ENST00000522314 724 ntTSL 2 BASIC8.2□□□□□ -1.11e-6■■■■■ 27.2
LARP4Q71RC2 ATOX1-202ENST00000520382 466 ntTSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.11e-6■■■■■ 27.2
LARP4Q71RC2 ATOX1-203ENST00000521264 4341 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.251e-6■■■■■ 27.2
LARP4Q71RC2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.135e-7■■■■■ 27.2
LARP4Q71RC2 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.475e-7■■■■■ 27.2
LARP4Q71RC2 IFI30-203ENST00000600463 2116 ntTSL 212.76□□□□□ -0.375e-7■■■■■ 27.2
LARP4Q71RC2 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.122e-31■■■■■ 27.1
LARP4Q71RC2 RPS29-207ENST00000557367 499 ntTSL 212.23□□□□□ -0.452e-31■■■■■ 27.1
LARP4Q71RC2 RPS29-202ENST00000396020 7062 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.312e-31■■■■■ 27.1
LARP4Q71RC2 RPS29-201ENST00000245458 296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.442e-31■■■■■ 27.1
LARP4Q71RC2 AC090360.1-202ENST00000562771 1032 ntAPPRIS P5 TSL 422.43■■□□□ 1.183e-7■■■■■ 27.1
LARP4Q71RC2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.183e-7■■■■■ 27.1
LARP4Q71RC2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.968e-14■■■■■ 27.1
LARP4Q71RC2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.813e-7■■■■■ 27.1
LARP4Q71RC2 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.613e-7■■■■■ 27.1
LARP4Q71RC2 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.53e-7■■■■■ 27.1
LARP4Q71RC2 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.443e-7■■■■■ 27.1
LARP4Q71RC2 TEX261-202ENST00000433258 758 ntTSL 217.65■□□□□ 0.423e-7■■■■■ 27.1
LARP4Q71RC2 GLYCTK-208ENST00000486393 2019 ntTSL 1 (best)16.96■□□□□ 0.313e-7■■■■■ 27.1
LARP4Q71RC2 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.243e-7■■■■■ 27.1
LARP4Q71RC2 GLYCTK-209ENST00000489173 2083 ntTSL 516.38■□□□□ 0.213e-7■■■■■ 27.1
LARP4Q71RC2 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.23e-7■■■■■ 27.1
LARP4Q71RC2 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.173e-7■■■■■ 27.1
LARP4Q71RC2 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.173e-7■■■■■ 27.1
LARP4Q71RC2 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.053e-7■■■■■ 27.1
LARP4Q71RC2 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.063e-7■■■■■ 27.1
LARP4Q71RC2 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.133e-7■■■■■ 27.1
LARP4Q71RC2 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.233e-7■■■■■ 27.1
LARP4Q71RC2 NUBP1-203ENST00000571175 674 ntTSL 213.5□□□□□ -0.253e-7■■■■■ 27.1
LARP4Q71RC2 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.253e-7■■■■■ 27.1
LARP4Q71RC2 INO80C-202ENST00000334598 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.283e-7■■■■■ 27.1
LARP4Q71RC2 AC007998.2-201ENST00000589258 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.343e-7■■■■■ 27.1
LARP4Q71RC2 AIMP2-201ENST00000223029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.373e-7■■■■■ 27.1
LARP4Q71RC2 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.383e-7■■■■■ 27.1
LARP4Q71RC2 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.433e-7■■■■■ 27.1
LARP4Q71RC2 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.453e-7■■■■■ 27.1
LARP4Q71RC2 NUBP1-201ENST00000283027 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.463e-7■■■■■ 27.1
LARP4Q71RC2 NUBP1-208ENST00000574691 517 ntTSL 511.74□□□□□ -0.533e-7■■■■■ 27.1
LARP4Q71RC2 FEN1-202ENST00000535307 768 ntTSL 211.58□□□□□ -0.563e-7■■■■■ 27.1
LARP4Q71RC2 RBFA-205ENST00000593019 1551 ntTSL 211.26□□□□□ -0.613e-7■■■■■ 27.1
LARP4Q71RC2 AC090360.1-203ENST00000591514 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 410.37□□□□□ -0.753e-7■■■■■ 27.1
LARP4Q71RC2 SAMD4B-206ENST00000596368 1176 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.773e-7■■■■■ 27.1
LARP4Q71RC2 NUBP1-205ENST00000573663 472 ntTSL 39.16□□□□□ -0.943e-7■■■■■ 27.1
LARP4Q71RC2 INO80C-212ENST00000592173 3245 ntTSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.133e-7■■■■■ 27.1
LARP4Q71RC2 AC090360.1-204ENST00000589713 444 ntTSL 26.7□□□□□ -1.343e-7■■■■■ 27.1
LARP4Q71RC2 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.28e-8■■■■■ 27.1
LARP4Q71RC2 TUBA1C-209ENST00000552448 1800 ntTSL 310.87□□□□□ -0.678e-8■■■■■ 27.1
LARP4Q71RC2 TUBA1C-202ENST00000541364 1695 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.758e-8■■■■■ 27.1
LARP4Q71RC2 TUBA1C-210ENST00000639419 1075 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.978e-8■■■■■ 27.1
LARP4Q71RC2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.271e-7■■■■■ 27.1
LARP4Q71RC2 LSM7-205ENST00000589532 539 ntTSL 321.52■■□□□ 1.041e-7■■■■■ 27.1
LARP4Q71RC2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.021e-7■■■■■ 27.1
LARP4Q71RC2 LSM7-202ENST00000585395 621 ntTSL 321.45■■□□□ 1.021e-7■■■■■ 27.1
LARP4Q71RC2 LSM7-206ENST00000591515 710 ntTSL 221.45■■□□□ 1.021e-7■■■■■ 27.1
LARP4Q71RC2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 11e-7■■■■■ 27.1
LARP4Q71RC2 MAD1L1-219ENST00000481633 548 ntTSL 213.47□□□□□ -0.256e-7■■■■■ 27.1
LARP4Q71RC2 SCMH1-207ENST00000372597 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.72e-6■■■■■ 27.1
LARP4Q71RC2 SCMH1-206ENST00000372596 3323 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.92e-6■■■■■ 27.1
LARP4Q71RC2 SCMH1-202ENST00000337495 3108 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.912e-6■■■■■ 27.1
LARP4Q71RC2 HCG17-214ENST00000453558 732 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.544e-6■■■■■ 27.1
Retrieved 100 of 15,922 protein–RNA pairs in 572 ms