Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXX9

RSPO2, R-spondin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO2Q6UXX9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RSPO2Q6UXX9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RSPO2Q6UXX9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RSPO2Q6UXX9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RSPO2Q6UXX9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RSPO2Q6UXX9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RSPO2Q6UXX9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RSPO2Q6UXX9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RSPO2Q6UXX9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RSPO2Q6UXX9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RSPO2Q6UXX9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RSPO2Q6UXX9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RSPO2Q6UXX9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RSPO2Q6UXX9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RSPO2Q6UXX9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RSPO2Q6UXX9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RSPO2Q6UXX9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RSPO2Q6UXX9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RSPO2Q6UXX9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RSPO2Q6UXX9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RSPO2Q6UXX9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RSPO2Q6UXX9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RSPO2Q6UXX9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RSPO2Q6UXX9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RSPO2Q6UXX9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RSPO2Q6UXX9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RSPO2Q6UXX9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RSPO2Q6UXX9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RSPO2Q6UXX9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RSPO2Q6UXX9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RSPO2Q6UXX9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RSPO2Q6UXX9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RSPO2Q6UXX9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RSPO2Q6UXX9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RSPO2Q6UXX9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RSPO2Q6UXX9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RSPO2Q6UXX9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RSPO2Q6UXX9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RSPO2Q6UXX9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RSPO2Q6UXX9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RSPO2Q6UXX9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RSPO2Q6UXX9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RSPO2Q6UXX9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RSPO2Q6UXX9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RSPO2Q6UXX9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RSPO2Q6UXX9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RSPO2Q6UXX9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RSPO2Q6UXX9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RSPO2Q6UXX9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RSPO2Q6UXX9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RSPO2Q6UXX9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RSPO2Q6UXX9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RSPO2Q6UXX9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RSPO2Q6UXX9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RSPO2Q6UXX9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RSPO2Q6UXX9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RSPO2Q6UXX9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RSPO2Q6UXX9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RSPO2Q6UXX9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RSPO2Q6UXX9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RSPO2Q6UXX9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RSPO2Q6UXX9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RSPO2Q6UXX9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RSPO2Q6UXX9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RSPO2Q6UXX9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RSPO2Q6UXX9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RSPO2Q6UXX9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RSPO2Q6UXX9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RSPO2Q6UXX9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RSPO2Q6UXX9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RSPO2Q6UXX9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RSPO2Q6UXX9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RSPO2Q6UXX9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RSPO2Q6UXX9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RSPO2Q6UXX9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RSPO2Q6UXX9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RSPO2Q6UXX9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RSPO2Q6UXX9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RSPO2Q6UXX9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RSPO2Q6UXX9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RSPO2Q6UXX9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RSPO2Q6UXX9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RSPO2Q6UXX9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RSPO2Q6UXX9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RSPO2Q6UXX9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RSPO2Q6UXX9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RSPO2Q6UXX9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RSPO2Q6UXX9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RSPO2Q6UXX9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RSPO2Q6UXX9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RSPO2Q6UXX9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RSPO2Q6UXX9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RSPO2Q6UXX9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RSPO2Q6UXX9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RSPO2Q6UXX9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RSPO2Q6UXX9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RSPO2Q6UXX9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RSPO2Q6UXX9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RSPO2Q6UXX9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RSPO2Q6UXX9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms