Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSX1

CCDC70, Coiled-coil domain-containing protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC70Q6NSX1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC70Q6NSX1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC70Q6NSX1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC70Q6NSX1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC70Q6NSX1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC70Q6NSX1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC70Q6NSX1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC70Q6NSX1 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC70Q6NSX1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC70Q6NSX1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC70Q6NSX1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC70Q6NSX1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC70Q6NSX1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC70Q6NSX1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC70Q6NSX1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC70Q6NSX1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC70Q6NSX1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC70Q6NSX1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC70Q6NSX1 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC70Q6NSX1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC70Q6NSX1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC70Q6NSX1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC70Q6NSX1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC70Q6NSX1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC70Q6NSX1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC70Q6NSX1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC70Q6NSX1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC70Q6NSX1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC70Q6NSX1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC70Q6NSX1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC70Q6NSX1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC70Q6NSX1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC70Q6NSX1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC70Q6NSX1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC70Q6NSX1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC70Q6NSX1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC70Q6NSX1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC70Q6NSX1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC70Q6NSX1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC70Q6NSX1 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC70Q6NSX1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC70Q6NSX1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC70Q6NSX1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC70Q6NSX1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC70Q6NSX1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC70Q6NSX1 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC70Q6NSX1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC70Q6NSX1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC70Q6NSX1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC70Q6NSX1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC70Q6NSX1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC70Q6NSX1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC70Q6NSX1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC70Q6NSX1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC70Q6NSX1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC70Q6NSX1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC70Q6NSX1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC70Q6NSX1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC70Q6NSX1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC70Q6NSX1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC70Q6NSX1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC70Q6NSX1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC70Q6NSX1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC70Q6NSX1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC70Q6NSX1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC70Q6NSX1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC70Q6NSX1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC70Q6NSX1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC70Q6NSX1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC70Q6NSX1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC70Q6NSX1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC70Q6NSX1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC70Q6NSX1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC70Q6NSX1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC70Q6NSX1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC70Q6NSX1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC70Q6NSX1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC70Q6NSX1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC70Q6NSX1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC70Q6NSX1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC70Q6NSX1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC70Q6NSX1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC70Q6NSX1 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC70Q6NSX1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC70Q6NSX1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC70Q6NSX1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC70Q6NSX1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC70Q6NSX1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC70Q6NSX1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC70Q6NSX1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC70Q6NSX1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC70Q6NSX1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC70Q6NSX1 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC70Q6NSX1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC70Q6NSX1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC70Q6NSX1 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC70Q6NSX1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC70Q6NSX1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC70Q6NSX1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC70Q6NSX1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms