Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC8EQ6NSJ5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC8EQ6NSJ5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC8EQ6NSJ5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC8EQ6NSJ5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC8EQ6NSJ5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC8EQ6NSJ5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC8EQ6NSJ5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC8EQ6NSJ5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC8EQ6NSJ5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC8EQ6NSJ5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC8EQ6NSJ5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC8EQ6NSJ5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC8EQ6NSJ5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC8EQ6NSJ5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC8EQ6NSJ5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC8EQ6NSJ5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC8EQ6NSJ5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC8EQ6NSJ5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC8EQ6NSJ5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC8EQ6NSJ5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC8EQ6NSJ5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC8EQ6NSJ5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC8EQ6NSJ5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC8EQ6NSJ5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC8EQ6NSJ5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC8EQ6NSJ5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC8EQ6NSJ5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRRC8EQ6NSJ5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC8EQ6NSJ5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC8EQ6NSJ5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC8EQ6NSJ5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC8EQ6NSJ5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC8EQ6NSJ5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC8EQ6NSJ5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC8EQ6NSJ5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC8EQ6NSJ5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC8EQ6NSJ5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC8EQ6NSJ5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC8EQ6NSJ5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC8EQ6NSJ5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC8EQ6NSJ5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC8EQ6NSJ5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC8EQ6NSJ5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC8EQ6NSJ5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC8EQ6NSJ5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC8EQ6NSJ5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC8EQ6NSJ5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC8EQ6NSJ5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC8EQ6NSJ5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC8EQ6NSJ5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC8EQ6NSJ5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC8EQ6NSJ5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC8EQ6NSJ5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC8EQ6NSJ5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC8EQ6NSJ5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC8EQ6NSJ5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC8EQ6NSJ5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC8EQ6NSJ5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC8EQ6NSJ5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC8EQ6NSJ5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC8EQ6NSJ5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC8EQ6NSJ5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC8EQ6NSJ5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC8EQ6NSJ5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC8EQ6NSJ5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC8EQ6NSJ5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC8EQ6NSJ5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC8EQ6NSJ5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC8EQ6NSJ5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC8EQ6NSJ5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC8EQ6NSJ5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC8EQ6NSJ5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC8EQ6NSJ5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC8EQ6NSJ5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC8EQ6NSJ5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC8EQ6NSJ5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC8EQ6NSJ5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC8EQ6NSJ5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC8EQ6NSJ5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC8EQ6NSJ5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC8EQ6NSJ5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC8EQ6NSJ5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC8EQ6NSJ5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC8EQ6NSJ5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC8EQ6NSJ5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC8EQ6NSJ5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC8EQ6NSJ5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC8EQ6NSJ5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC8EQ6NSJ5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
LRRC8EQ6NSJ5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC8EQ6NSJ5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC8EQ6NSJ5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC8EQ6NSJ5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC8EQ6NSJ5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC8EQ6NSJ5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC8EQ6NSJ5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC8EQ6NSJ5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms