Protein–RNA interactions for Protein: Q6MZZ7

CAPN13, Calpain-13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN13Q6MZZ7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN13Q6MZZ7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN13Q6MZZ7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN13Q6MZZ7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN13Q6MZZ7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN13Q6MZZ7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN13Q6MZZ7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN13Q6MZZ7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN13Q6MZZ7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN13Q6MZZ7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN13Q6MZZ7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN13Q6MZZ7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN13Q6MZZ7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN13Q6MZZ7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN13Q6MZZ7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN13Q6MZZ7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN13Q6MZZ7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN13Q6MZZ7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN13Q6MZZ7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN13Q6MZZ7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN13Q6MZZ7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN13Q6MZZ7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN13Q6MZZ7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN13Q6MZZ7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN13Q6MZZ7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN13Q6MZZ7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN13Q6MZZ7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN13Q6MZZ7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN13Q6MZZ7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPN13Q6MZZ7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPN13Q6MZZ7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPN13Q6MZZ7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPN13Q6MZZ7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPN13Q6MZZ7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPN13Q6MZZ7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPN13Q6MZZ7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPN13Q6MZZ7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPN13Q6MZZ7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPN13Q6MZZ7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPN13Q6MZZ7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPN13Q6MZZ7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPN13Q6MZZ7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPN13Q6MZZ7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPN13Q6MZZ7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPN13Q6MZZ7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPN13Q6MZZ7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPN13Q6MZZ7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPN13Q6MZZ7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPN13Q6MZZ7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN13Q6MZZ7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN13Q6MZZ7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN13Q6MZZ7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN13Q6MZZ7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN13Q6MZZ7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN13Q6MZZ7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN13Q6MZZ7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN13Q6MZZ7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN13Q6MZZ7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN13Q6MZZ7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN13Q6MZZ7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN13Q6MZZ7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN13Q6MZZ7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN13Q6MZZ7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN13Q6MZZ7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN13Q6MZZ7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN13Q6MZZ7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN13Q6MZZ7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN13Q6MZZ7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN13Q6MZZ7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN13Q6MZZ7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN13Q6MZZ7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN13Q6MZZ7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN13Q6MZZ7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN13Q6MZZ7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN13Q6MZZ7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN13Q6MZZ7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN13Q6MZZ7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN13Q6MZZ7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN13Q6MZZ7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN13Q6MZZ7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN13Q6MZZ7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN13Q6MZZ7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN13Q6MZZ7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN13Q6MZZ7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN13Q6MZZ7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN13Q6MZZ7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN13Q6MZZ7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN13Q6MZZ7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN13Q6MZZ7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN13Q6MZZ7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN13Q6MZZ7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN13Q6MZZ7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN13Q6MZZ7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN13Q6MZZ7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN13Q6MZZ7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN13Q6MZZ7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN13Q6MZZ7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN13Q6MZZ7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN13Q6MZZ7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN13Q6MZZ7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms