Protein–RNA interactions for Protein: Q69YZ2

TMEM200B, Transmembrane protein 200B, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200BQ69YZ2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM200BQ69YZ2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM200BQ69YZ2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM200BQ69YZ2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM200BQ69YZ2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM200BQ69YZ2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM200BQ69YZ2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM200BQ69YZ2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM200BQ69YZ2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM200BQ69YZ2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM200BQ69YZ2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM200BQ69YZ2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM200BQ69YZ2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM200BQ69YZ2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM200BQ69YZ2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM200BQ69YZ2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM200BQ69YZ2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM200BQ69YZ2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM200BQ69YZ2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM200BQ69YZ2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM200BQ69YZ2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM200BQ69YZ2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM200BQ69YZ2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM200BQ69YZ2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM200BQ69YZ2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM200BQ69YZ2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM200BQ69YZ2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM200BQ69YZ2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM200BQ69YZ2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM200BQ69YZ2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM200BQ69YZ2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM200BQ69YZ2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM200BQ69YZ2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
TMEM200BQ69YZ2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TMEM200BQ69YZ2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM200BQ69YZ2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM200BQ69YZ2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM200BQ69YZ2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM200BQ69YZ2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM200BQ69YZ2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM200BQ69YZ2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM200BQ69YZ2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM200BQ69YZ2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM200BQ69YZ2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM200BQ69YZ2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM200BQ69YZ2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM200BQ69YZ2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM200BQ69YZ2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM200BQ69YZ2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM200BQ69YZ2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM200BQ69YZ2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM200BQ69YZ2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM200BQ69YZ2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM200BQ69YZ2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM200BQ69YZ2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM200BQ69YZ2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM200BQ69YZ2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM200BQ69YZ2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM200BQ69YZ2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM200BQ69YZ2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM200BQ69YZ2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM200BQ69YZ2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM200BQ69YZ2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM200BQ69YZ2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM200BQ69YZ2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM200BQ69YZ2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM200BQ69YZ2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM200BQ69YZ2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM200BQ69YZ2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM200BQ69YZ2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM200BQ69YZ2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM200BQ69YZ2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM200BQ69YZ2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM200BQ69YZ2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM200BQ69YZ2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM200BQ69YZ2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM200BQ69YZ2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM200BQ69YZ2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM200BQ69YZ2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM200BQ69YZ2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM200BQ69YZ2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM200BQ69YZ2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM200BQ69YZ2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM200BQ69YZ2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM200BQ69YZ2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM200BQ69YZ2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM200BQ69YZ2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM200BQ69YZ2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMEM200BQ69YZ2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMEM200BQ69YZ2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMEM200BQ69YZ2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMEM200BQ69YZ2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMEM200BQ69YZ2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMEM200BQ69YZ2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEM200BQ69YZ2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEM200BQ69YZ2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEM200BQ69YZ2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEM200BQ69YZ2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEM200BQ69YZ2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEM200BQ69YZ2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms