Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG16L1Q676U5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG16L1Q676U5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG16L1Q676U5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG16L1Q676U5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG16L1Q676U5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG16L1Q676U5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG16L1Q676U5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG16L1Q676U5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG16L1Q676U5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG16L1Q676U5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG16L1Q676U5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG16L1Q676U5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG16L1Q676U5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG16L1Q676U5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG16L1Q676U5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG16L1Q676U5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG16L1Q676U5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG16L1Q676U5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG16L1Q676U5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG16L1Q676U5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATG16L1Q676U5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATG16L1Q676U5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATG16L1Q676U5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ATG16L1Q676U5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ATG16L1Q676U5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATG16L1Q676U5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATG16L1Q676U5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATG16L1Q676U5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATG16L1Q676U5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATG16L1Q676U5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATG16L1Q676U5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATG16L1Q676U5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATG16L1Q676U5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ATG16L1Q676U5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATG16L1Q676U5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATG16L1Q676U5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATG16L1Q676U5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATG16L1Q676U5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATG16L1Q676U5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATG16L1Q676U5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATG16L1Q676U5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATG16L1Q676U5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATG16L1Q676U5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATG16L1Q676U5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATG16L1Q676U5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ATG16L1Q676U5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATG16L1Q676U5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATG16L1Q676U5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATG16L1Q676U5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATG16L1Q676U5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATG16L1Q676U5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATG16L1Q676U5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATG16L1Q676U5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATG16L1Q676U5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATG16L1Q676U5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATG16L1Q676U5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ATG16L1Q676U5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATG16L1Q676U5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATG16L1Q676U5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATG16L1Q676U5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATG16L1Q676U5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATG16L1Q676U5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATG16L1Q676U5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATG16L1Q676U5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATG16L1Q676U5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATG16L1Q676U5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATG16L1Q676U5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATG16L1Q676U5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATG16L1Q676U5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATG16L1Q676U5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATG16L1Q676U5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATG16L1Q676U5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATG16L1Q676U5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATG16L1Q676U5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATG16L1Q676U5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATG16L1Q676U5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATG16L1Q676U5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATG16L1Q676U5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATG16L1Q676U5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATG16L1Q676U5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATG16L1Q676U5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATG16L1Q676U5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATG16L1Q676U5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATG16L1Q676U5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATG16L1Q676U5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATG16L1Q676U5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ATG16L1Q676U5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATG16L1Q676U5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATG16L1Q676U5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATG16L1Q676U5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATG16L1Q676U5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATG16L1Q676U5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATG16L1Q676U5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATG16L1Q676U5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATG16L1Q676U5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATG16L1Q676U5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATG16L1Q676U5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATG16L1Q676U5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATG16L1Q676U5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms