Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RNF20Q5VTR2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RNF20Q5VTR2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RNF20Q5VTR2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RNF20Q5VTR2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RNF20Q5VTR2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RNF20Q5VTR2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RNF20Q5VTR2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RNF20Q5VTR2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RNF20Q5VTR2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RNF20Q5VTR2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RNF20Q5VTR2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RNF20Q5VTR2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RNF20Q5VTR2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RNF20Q5VTR2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RNF20Q5VTR2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RNF20Q5VTR2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RNF20Q5VTR2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RNF20Q5VTR2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RNF20Q5VTR2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
RNF20Q5VTR2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RNF20Q5VTR2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RNF20Q5VTR2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RNF20Q5VTR2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RNF20Q5VTR2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RNF20Q5VTR2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RNF20Q5VTR2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RNF20Q5VTR2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
RNF20Q5VTR2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RNF20Q5VTR2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RNF20Q5VTR2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RNF20Q5VTR2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RNF20Q5VTR2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RNF20Q5VTR2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RNF20Q5VTR2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RNF20Q5VTR2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RNF20Q5VTR2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RNF20Q5VTR2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RNF20Q5VTR2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RNF20Q5VTR2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RNF20Q5VTR2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RNF20Q5VTR2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RNF20Q5VTR2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
RNF20Q5VTR2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RNF20Q5VTR2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RNF20Q5VTR2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RNF20Q5VTR2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RNF20Q5VTR2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RNF20Q5VTR2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RNF20Q5VTR2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RNF20Q5VTR2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
RNF20Q5VTR2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
RNF20Q5VTR2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RNF20Q5VTR2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RNF20Q5VTR2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RNF20Q5VTR2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RNF20Q5VTR2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RNF20Q5VTR2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RNF20Q5VTR2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RNF20Q5VTR2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RNF20Q5VTR2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RNF20Q5VTR2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF20Q5VTR2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF20Q5VTR2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF20Q5VTR2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF20Q5VTR2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF20Q5VTR2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RNF20Q5VTR2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RNF20Q5VTR2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RNF20Q5VTR2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RNF20Q5VTR2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RNF20Q5VTR2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RNF20Q5VTR2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RNF20Q5VTR2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RNF20Q5VTR2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RNF20Q5VTR2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RNF20Q5VTR2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RNF20Q5VTR2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RNF20Q5VTR2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RNF20Q5VTR2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RNF20Q5VTR2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RNF20Q5VTR2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RNF20Q5VTR2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RNF20Q5VTR2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNF20Q5VTR2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNF20Q5VTR2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNF20Q5VTR2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNF20Q5VTR2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNF20Q5VTR2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNF20Q5VTR2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNF20Q5VTR2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNF20Q5VTR2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNF20Q5VTR2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNF20Q5VTR2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNF20Q5VTR2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RNF20Q5VTR2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RNF20Q5VTR2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RNF20Q5VTR2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RNF20Q5VTR2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RNF20Q5VTR2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms