Protein–RNA interactions for Protein: Q5C9Z4

NOM1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOM1Q5C9Z4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NOM1Q5C9Z4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NOM1Q5C9Z4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
NOM1Q5C9Z4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
NOM1Q5C9Z4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NOM1Q5C9Z4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NOM1Q5C9Z4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
NOM1Q5C9Z4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NOM1Q5C9Z4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NOM1Q5C9Z4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NOM1Q5C9Z4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
NOM1Q5C9Z4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NOM1Q5C9Z4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NOM1Q5C9Z4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NOM1Q5C9Z4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NOM1Q5C9Z4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NOM1Q5C9Z4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NOM1Q5C9Z4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
NOM1Q5C9Z4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NOM1Q5C9Z4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NOM1Q5C9Z4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NOM1Q5C9Z4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NOM1Q5C9Z4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NOM1Q5C9Z4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NOM1Q5C9Z4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NOM1Q5C9Z4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NOM1Q5C9Z4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NOM1Q5C9Z4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NOM1Q5C9Z4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NOM1Q5C9Z4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NOM1Q5C9Z4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
NOM1Q5C9Z4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NOM1Q5C9Z4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NOM1Q5C9Z4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NOM1Q5C9Z4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NOM1Q5C9Z4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NOM1Q5C9Z4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NOM1Q5C9Z4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NOM1Q5C9Z4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
NOM1Q5C9Z4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NOM1Q5C9Z4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NOM1Q5C9Z4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NOM1Q5C9Z4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
NOM1Q5C9Z4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
NOM1Q5C9Z4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NOM1Q5C9Z4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NOM1Q5C9Z4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NOM1Q5C9Z4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
NOM1Q5C9Z4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NOM1Q5C9Z4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NOM1Q5C9Z4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NOM1Q5C9Z4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NOM1Q5C9Z4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
NOM1Q5C9Z4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NOM1Q5C9Z4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NOM1Q5C9Z4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NOM1Q5C9Z4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NOM1Q5C9Z4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NOM1Q5C9Z4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NOM1Q5C9Z4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NOM1Q5C9Z4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NOM1Q5C9Z4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NOM1Q5C9Z4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NOM1Q5C9Z4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NOM1Q5C9Z4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NOM1Q5C9Z4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NOM1Q5C9Z4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NOM1Q5C9Z4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NOM1Q5C9Z4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
NOM1Q5C9Z4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NOM1Q5C9Z4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NOM1Q5C9Z4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NOM1Q5C9Z4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NOM1Q5C9Z4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NOM1Q5C9Z4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NOM1Q5C9Z4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NOM1Q5C9Z4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
NOM1Q5C9Z4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NOM1Q5C9Z4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NOM1Q5C9Z4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NOM1Q5C9Z4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NOM1Q5C9Z4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
NOM1Q5C9Z4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NOM1Q5C9Z4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NOM1Q5C9Z4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NOM1Q5C9Z4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NOM1Q5C9Z4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.57■■■□□ 2
NOM1Q5C9Z4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NOM1Q5C9Z4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NOM1Q5C9Z4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NOM1Q5C9Z4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NOM1Q5C9Z4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
NOM1Q5C9Z4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NOM1Q5C9Z4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NOM1Q5C9Z4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NOM1Q5C9Z4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NOM1Q5C9Z4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NOM1Q5C9Z4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NOM1Q5C9Z4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NOM1Q5C9Z4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms