Protein–RNA interactions for Protein: Q5BN46

C9orf116, UPF0691 protein C9orf116, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf116Q5BN46 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf116Q5BN46 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf116Q5BN46 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf116Q5BN46 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf116Q5BN46 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf116Q5BN46 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf116Q5BN46 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf116Q5BN46 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf116Q5BN46 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf116Q5BN46 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf116Q5BN46 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf116Q5BN46 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf116Q5BN46 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf116Q5BN46 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf116Q5BN46 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf116Q5BN46 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf116Q5BN46 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf116Q5BN46 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf116Q5BN46 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf116Q5BN46 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf116Q5BN46 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf116Q5BN46 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf116Q5BN46 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf116Q5BN46 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf116Q5BN46 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf116Q5BN46 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf116Q5BN46 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf116Q5BN46 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf116Q5BN46 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf116Q5BN46 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf116Q5BN46 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf116Q5BN46 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf116Q5BN46 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf116Q5BN46 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf116Q5BN46 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf116Q5BN46 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf116Q5BN46 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf116Q5BN46 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf116Q5BN46 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf116Q5BN46 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf116Q5BN46 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C9orf116Q5BN46 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf116Q5BN46 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf116Q5BN46 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf116Q5BN46 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf116Q5BN46 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf116Q5BN46 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf116Q5BN46 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf116Q5BN46 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf116Q5BN46 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf116Q5BN46 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf116Q5BN46 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf116Q5BN46 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf116Q5BN46 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf116Q5BN46 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf116Q5BN46 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf116Q5BN46 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf116Q5BN46 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf116Q5BN46 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf116Q5BN46 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf116Q5BN46 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf116Q5BN46 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf116Q5BN46 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf116Q5BN46 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf116Q5BN46 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf116Q5BN46 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf116Q5BN46 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf116Q5BN46 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf116Q5BN46 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf116Q5BN46 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf116Q5BN46 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf116Q5BN46 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf116Q5BN46 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf116Q5BN46 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf116Q5BN46 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf116Q5BN46 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf116Q5BN46 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf116Q5BN46 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf116Q5BN46 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf116Q5BN46 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf116Q5BN46 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf116Q5BN46 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf116Q5BN46 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf116Q5BN46 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf116Q5BN46 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf116Q5BN46 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf116Q5BN46 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf116Q5BN46 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf116Q5BN46 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf116Q5BN46 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf116Q5BN46 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf116Q5BN46 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf116Q5BN46 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf116Q5BN46 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf116Q5BN46 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf116Q5BN46 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf116Q5BN46 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf116Q5BN46 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf116Q5BN46 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf116Q5BN46 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms