Protein–RNA interactions for Protein: Q53T94

TAF1B, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1BQ53T94 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TAF1BQ53T94 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TAF1BQ53T94 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TAF1BQ53T94 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TAF1BQ53T94 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAF1BQ53T94 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAF1BQ53T94 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAF1BQ53T94 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAF1BQ53T94 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAF1BQ53T94 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAF1BQ53T94 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAF1BQ53T94 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAF1BQ53T94 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAF1BQ53T94 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAF1BQ53T94 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAF1BQ53T94 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAF1BQ53T94 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAF1BQ53T94 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAF1BQ53T94 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TAF1BQ53T94 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAF1BQ53T94 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAF1BQ53T94 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAF1BQ53T94 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAF1BQ53T94 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAF1BQ53T94 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAF1BQ53T94 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF1BQ53T94 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF1BQ53T94 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF1BQ53T94 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF1BQ53T94 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF1BQ53T94 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF1BQ53T94 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF1BQ53T94 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF1BQ53T94 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF1BQ53T94 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF1BQ53T94 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF1BQ53T94 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF1BQ53T94 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF1BQ53T94 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF1BQ53T94 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF1BQ53T94 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF1BQ53T94 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF1BQ53T94 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF1BQ53T94 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF1BQ53T94 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF1BQ53T94 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF1BQ53T94 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF1BQ53T94 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF1BQ53T94 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF1BQ53T94 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF1BQ53T94 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF1BQ53T94 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF1BQ53T94 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF1BQ53T94 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF1BQ53T94 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF1BQ53T94 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF1BQ53T94 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF1BQ53T94 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF1BQ53T94 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF1BQ53T94 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF1BQ53T94 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF1BQ53T94 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF1BQ53T94 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF1BQ53T94 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF1BQ53T94 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF1BQ53T94 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF1BQ53T94 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF1BQ53T94 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF1BQ53T94 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF1BQ53T94 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF1BQ53T94 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TAF1BQ53T94 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF1BQ53T94 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF1BQ53T94 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF1BQ53T94 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF1BQ53T94 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF1BQ53T94 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF1BQ53T94 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF1BQ53T94 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF1BQ53T94 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF1BQ53T94 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF1BQ53T94 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF1BQ53T94 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF1BQ53T94 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TAF1BQ53T94 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TAF1BQ53T94 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TAF1BQ53T94 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TAF1BQ53T94 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TAF1BQ53T94 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TAF1BQ53T94 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TAF1BQ53T94 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TAF1BQ53T94 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TAF1BQ53T94 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TAF1BQ53T94 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TAF1BQ53T94 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TAF1BQ53T94 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TAF1BQ53T94 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TAF1BQ53T94 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TAF1BQ53T94 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TAF1BQ53T94 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms