Protein–RNA interactions for Protein: Q53GI3

ZNF394, Zinc finger protein 394, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF394Q53GI3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF394Q53GI3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF394Q53GI3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF394Q53GI3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF394Q53GI3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF394Q53GI3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF394Q53GI3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF394Q53GI3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF394Q53GI3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF394Q53GI3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF394Q53GI3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF394Q53GI3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF394Q53GI3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ZNF394Q53GI3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF394Q53GI3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF394Q53GI3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF394Q53GI3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF394Q53GI3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF394Q53GI3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF394Q53GI3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF394Q53GI3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF394Q53GI3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF394Q53GI3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF394Q53GI3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF394Q53GI3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF394Q53GI3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF394Q53GI3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF394Q53GI3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF394Q53GI3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF394Q53GI3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF394Q53GI3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF394Q53GI3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF394Q53GI3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF394Q53GI3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF394Q53GI3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF394Q53GI3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF394Q53GI3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF394Q53GI3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF394Q53GI3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF394Q53GI3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF394Q53GI3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF394Q53GI3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF394Q53GI3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF394Q53GI3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF394Q53GI3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF394Q53GI3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF394Q53GI3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF394Q53GI3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF394Q53GI3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF394Q53GI3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF394Q53GI3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF394Q53GI3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF394Q53GI3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF394Q53GI3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF394Q53GI3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF394Q53GI3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF394Q53GI3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF394Q53GI3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF394Q53GI3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF394Q53GI3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF394Q53GI3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF394Q53GI3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF394Q53GI3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF394Q53GI3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF394Q53GI3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF394Q53GI3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF394Q53GI3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF394Q53GI3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF394Q53GI3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF394Q53GI3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF394Q53GI3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF394Q53GI3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF394Q53GI3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF394Q53GI3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF394Q53GI3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF394Q53GI3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF394Q53GI3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF394Q53GI3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF394Q53GI3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF394Q53GI3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF394Q53GI3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF394Q53GI3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF394Q53GI3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF394Q53GI3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF394Q53GI3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF394Q53GI3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF394Q53GI3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF394Q53GI3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF394Q53GI3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF394Q53GI3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF394Q53GI3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF394Q53GI3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF394Q53GI3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF394Q53GI3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF394Q53GI3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF394Q53GI3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF394Q53GI3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF394Q53GI3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF394Q53GI3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF394Q53GI3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms