Protein–RNA interactions for Protein: Q53GD3

SLC44A4, Choline transporter-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC44A4Q53GD3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC44A4Q53GD3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC44A4Q53GD3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC44A4Q53GD3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC44A4Q53GD3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC44A4Q53GD3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC44A4Q53GD3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC44A4Q53GD3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC44A4Q53GD3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC44A4Q53GD3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC44A4Q53GD3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC44A4Q53GD3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC44A4Q53GD3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC44A4Q53GD3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC44A4Q53GD3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC44A4Q53GD3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC44A4Q53GD3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC44A4Q53GD3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC44A4Q53GD3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC44A4Q53GD3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC44A4Q53GD3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC44A4Q53GD3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC44A4Q53GD3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC44A4Q53GD3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC44A4Q53GD3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC44A4Q53GD3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC44A4Q53GD3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC44A4Q53GD3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC44A4Q53GD3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC44A4Q53GD3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC44A4Q53GD3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC44A4Q53GD3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC44A4Q53GD3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC44A4Q53GD3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC44A4Q53GD3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC44A4Q53GD3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC44A4Q53GD3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC44A4Q53GD3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC44A4Q53GD3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC44A4Q53GD3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC44A4Q53GD3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC44A4Q53GD3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC44A4Q53GD3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC44A4Q53GD3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC44A4Q53GD3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC44A4Q53GD3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC44A4Q53GD3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC44A4Q53GD3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC44A4Q53GD3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC44A4Q53GD3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC44A4Q53GD3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC44A4Q53GD3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC44A4Q53GD3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC44A4Q53GD3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC44A4Q53GD3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC44A4Q53GD3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC44A4Q53GD3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC44A4Q53GD3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC44A4Q53GD3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC44A4Q53GD3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC44A4Q53GD3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC44A4Q53GD3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC44A4Q53GD3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC44A4Q53GD3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC44A4Q53GD3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC44A4Q53GD3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC44A4Q53GD3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC44A4Q53GD3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC44A4Q53GD3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC44A4Q53GD3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC44A4Q53GD3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC44A4Q53GD3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC44A4Q53GD3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC44A4Q53GD3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC44A4Q53GD3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC44A4Q53GD3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC44A4Q53GD3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC44A4Q53GD3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC44A4Q53GD3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC44A4Q53GD3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC44A4Q53GD3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC44A4Q53GD3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SLC44A4Q53GD3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC44A4Q53GD3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC44A4Q53GD3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC44A4Q53GD3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC44A4Q53GD3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC44A4Q53GD3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC44A4Q53GD3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC44A4Q53GD3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC44A4Q53GD3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC44A4Q53GD3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC44A4Q53GD3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC44A4Q53GD3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC44A4Q53GD3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC44A4Q53GD3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC44A4Q53GD3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC44A4Q53GD3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC44A4Q53GD3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC44A4Q53GD3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms