Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0U5

CFAP221, Cilia- and flagella-associated protein 221, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP221Q4G0U5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP221Q4G0U5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP221Q4G0U5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP221Q4G0U5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP221Q4G0U5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFAP221Q4G0U5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFAP221Q4G0U5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFAP221Q4G0U5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFAP221Q4G0U5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFAP221Q4G0U5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFAP221Q4G0U5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFAP221Q4G0U5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFAP221Q4G0U5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFAP221Q4G0U5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFAP221Q4G0U5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFAP221Q4G0U5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFAP221Q4G0U5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFAP221Q4G0U5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFAP221Q4G0U5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFAP221Q4G0U5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFAP221Q4G0U5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFAP221Q4G0U5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFAP221Q4G0U5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFAP221Q4G0U5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFAP221Q4G0U5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CFAP221Q4G0U5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CFAP221Q4G0U5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CFAP221Q4G0U5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CFAP221Q4G0U5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CFAP221Q4G0U5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CFAP221Q4G0U5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CFAP221Q4G0U5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CFAP221Q4G0U5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CFAP221Q4G0U5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CFAP221Q4G0U5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CFAP221Q4G0U5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CFAP221Q4G0U5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CFAP221Q4G0U5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CFAP221Q4G0U5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CFAP221Q4G0U5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CFAP221Q4G0U5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CFAP221Q4G0U5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFAP221Q4G0U5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFAP221Q4G0U5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CFAP221Q4G0U5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFAP221Q4G0U5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFAP221Q4G0U5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFAP221Q4G0U5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFAP221Q4G0U5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFAP221Q4G0U5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFAP221Q4G0U5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFAP221Q4G0U5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFAP221Q4G0U5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFAP221Q4G0U5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFAP221Q4G0U5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFAP221Q4G0U5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFAP221Q4G0U5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CFAP221Q4G0U5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CFAP221Q4G0U5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CFAP221Q4G0U5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CFAP221Q4G0U5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CFAP221Q4G0U5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CFAP221Q4G0U5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CFAP221Q4G0U5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFAP221Q4G0U5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFAP221Q4G0U5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFAP221Q4G0U5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFAP221Q4G0U5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFAP221Q4G0U5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFAP221Q4G0U5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFAP221Q4G0U5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFAP221Q4G0U5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFAP221Q4G0U5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFAP221Q4G0U5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFAP221Q4G0U5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFAP221Q4G0U5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CFAP221Q4G0U5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CFAP221Q4G0U5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CFAP221Q4G0U5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CFAP221Q4G0U5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CFAP221Q4G0U5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CFAP221Q4G0U5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CFAP221Q4G0U5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CFAP221Q4G0U5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CFAP221Q4G0U5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CFAP221Q4G0U5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CFAP221Q4G0U5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CFAP221Q4G0U5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CFAP221Q4G0U5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CFAP221Q4G0U5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CFAP221Q4G0U5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CFAP221Q4G0U5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CFAP221Q4G0U5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CFAP221Q4G0U5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CFAP221Q4G0U5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CFAP221Q4G0U5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CFAP221Q4G0U5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CFAP221Q4G0U5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFAP221Q4G0U5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFAP221Q4G0U5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms