Protein–RNA interactions for Protein: Q17RP2

TIGD6, Tigger transposable element-derived protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIGD6Q17RP2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TIGD6Q17RP2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TIGD6Q17RP2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TIGD6Q17RP2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TIGD6Q17RP2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TIGD6Q17RP2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TIGD6Q17RP2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TIGD6Q17RP2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TIGD6Q17RP2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TIGD6Q17RP2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TIGD6Q17RP2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TIGD6Q17RP2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TIGD6Q17RP2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TIGD6Q17RP2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TIGD6Q17RP2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TIGD6Q17RP2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TIGD6Q17RP2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TIGD6Q17RP2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TIGD6Q17RP2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TIGD6Q17RP2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TIGD6Q17RP2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TIGD6Q17RP2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TIGD6Q17RP2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TIGD6Q17RP2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TIGD6Q17RP2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TIGD6Q17RP2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TIGD6Q17RP2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TIGD6Q17RP2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TIGD6Q17RP2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TIGD6Q17RP2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TIGD6Q17RP2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TIGD6Q17RP2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TIGD6Q17RP2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TIGD6Q17RP2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TIGD6Q17RP2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TIGD6Q17RP2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TIGD6Q17RP2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TIGD6Q17RP2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TIGD6Q17RP2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TIGD6Q17RP2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TIGD6Q17RP2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TIGD6Q17RP2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TIGD6Q17RP2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TIGD6Q17RP2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TIGD6Q17RP2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TIGD6Q17RP2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TIGD6Q17RP2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TIGD6Q17RP2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TIGD6Q17RP2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TIGD6Q17RP2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TIGD6Q17RP2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TIGD6Q17RP2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TIGD6Q17RP2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TIGD6Q17RP2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TIGD6Q17RP2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TIGD6Q17RP2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
TIGD6Q17RP2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TIGD6Q17RP2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TIGD6Q17RP2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TIGD6Q17RP2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TIGD6Q17RP2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TIGD6Q17RP2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TIGD6Q17RP2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TIGD6Q17RP2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TIGD6Q17RP2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TIGD6Q17RP2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TIGD6Q17RP2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TIGD6Q17RP2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TIGD6Q17RP2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TIGD6Q17RP2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TIGD6Q17RP2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TIGD6Q17RP2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TIGD6Q17RP2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TIGD6Q17RP2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TIGD6Q17RP2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TIGD6Q17RP2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TIGD6Q17RP2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TIGD6Q17RP2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TIGD6Q17RP2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TIGD6Q17RP2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TIGD6Q17RP2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TIGD6Q17RP2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TIGD6Q17RP2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TIGD6Q17RP2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TIGD6Q17RP2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TIGD6Q17RP2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TIGD6Q17RP2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TIGD6Q17RP2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TIGD6Q17RP2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TIGD6Q17RP2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TIGD6Q17RP2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TIGD6Q17RP2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TIGD6Q17RP2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TIGD6Q17RP2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TIGD6Q17RP2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TIGD6Q17RP2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TIGD6Q17RP2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TIGD6Q17RP2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TIGD6Q17RP2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TIGD6Q17RP2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms