Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGCBQ16585 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGCBQ16585 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SGCBQ16585 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SGCBQ16585 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SGCBQ16585 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SGCBQ16585 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SGCBQ16585 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SGCBQ16585 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SGCBQ16585 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SGCBQ16585 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SGCBQ16585 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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SGCBQ16585 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGCBQ16585 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGCBQ16585 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGCBQ16585 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGCBQ16585 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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SGCBQ16585 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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SGCBQ16585 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGCBQ16585 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGCBQ16585 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGCBQ16585 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGCBQ16585 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGCBQ16585 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGCBQ16585 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGCBQ16585 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGCBQ16585 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGCBQ16585 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGCBQ16585 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
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SGCBQ16585 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGCBQ16585 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SGCBQ16585 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGCBQ16585 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SGCBQ16585 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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SGCBQ16585 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGCBQ16585 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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SGCBQ16585 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGCBQ16585 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGCBQ16585 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGCBQ16585 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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SGCBQ16585 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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SGCBQ16585 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGCBQ16585 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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SGCBQ16585 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGCBQ16585 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGCBQ16585 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGCBQ16585 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGCBQ16585 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SGCBQ16585 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SGCBQ16585 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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SGCBQ16585 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
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SGCBQ16585 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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SGCBQ16585 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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SGCBQ16585 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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SGCBQ16585 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SGCBQ16585 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SGCBQ16585 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SGCBQ16585 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SGCBQ16585 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGCBQ16585 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGCBQ16585 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGCBQ16585 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGCBQ16585 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGCBQ16585 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGCBQ16585 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGCBQ16585 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGCBQ16585 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGCBQ16585 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SGCBQ16585 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SGCBQ16585 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SGCBQ16585 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
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