Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNGA3Q16281 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNGA3Q16281 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNGA3Q16281 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNGA3Q16281 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNGA3Q16281 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNGA3Q16281 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNGA3Q16281 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNGA3Q16281 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNGA3Q16281 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CNGA3Q16281 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNGA3Q16281 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNGA3Q16281 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNGA3Q16281 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNGA3Q16281 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNGA3Q16281 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNGA3Q16281 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNGA3Q16281 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNGA3Q16281 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNGA3Q16281 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNGA3Q16281 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNGA3Q16281 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNGA3Q16281 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNGA3Q16281 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNGA3Q16281 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNGA3Q16281 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNGA3Q16281 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNGA3Q16281 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNGA3Q16281 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNGA3Q16281 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNGA3Q16281 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNGA3Q16281 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNGA3Q16281 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNGA3Q16281 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNGA3Q16281 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNGA3Q16281 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNGA3Q16281 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNGA3Q16281 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNGA3Q16281 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNGA3Q16281 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNGA3Q16281 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNGA3Q16281 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CNGA3Q16281 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CNGA3Q16281 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CNGA3Q16281 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNGA3Q16281 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CNGA3Q16281 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CNGA3Q16281 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CNGA3Q16281 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CNGA3Q16281 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNGA3Q16281 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNGA3Q16281 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNGA3Q16281 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNGA3Q16281 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNGA3Q16281 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNGA3Q16281 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNGA3Q16281 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNGA3Q16281 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNGA3Q16281 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNGA3Q16281 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNGA3Q16281 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNGA3Q16281 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNGA3Q16281 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNGA3Q16281 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNGA3Q16281 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNGA3Q16281 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNGA3Q16281 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNGA3Q16281 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNGA3Q16281 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CNGA3Q16281 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CNGA3Q16281 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNGA3Q16281 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNGA3Q16281 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNGA3Q16281 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNGA3Q16281 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNGA3Q16281 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNGA3Q16281 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNGA3Q16281 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNGA3Q16281 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNGA3Q16281 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CNGA3Q16281 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNGA3Q16281 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNGA3Q16281 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNGA3Q16281 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNGA3Q16281 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNGA3Q16281 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNGA3Q16281 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNGA3Q16281 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNGA3Q16281 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNGA3Q16281 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNGA3Q16281 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNGA3Q16281 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNGA3Q16281 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNGA3Q16281 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNGA3Q16281 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNGA3Q16281 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNGA3Q16281 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNGA3Q16281 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNGA3Q16281 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CNGA3Q16281 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms