Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNHIT3Q15649 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNHIT3Q15649 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNHIT3Q15649 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNHIT3Q15649 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNHIT3Q15649 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNHIT3Q15649 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNHIT3Q15649 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNHIT3Q15649 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNHIT3Q15649 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNHIT3Q15649 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNHIT3Q15649 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNHIT3Q15649 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNHIT3Q15649 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNHIT3Q15649 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNHIT3Q15649 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNHIT3Q15649 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNHIT3Q15649 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNHIT3Q15649 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNHIT3Q15649 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNHIT3Q15649 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNHIT3Q15649 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNHIT3Q15649 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNHIT3Q15649 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNHIT3Q15649 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNHIT3Q15649 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNHIT3Q15649 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNHIT3Q15649 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNHIT3Q15649 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNHIT3Q15649 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNHIT3Q15649 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNHIT3Q15649 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNHIT3Q15649 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNHIT3Q15649 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNHIT3Q15649 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNHIT3Q15649 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNHIT3Q15649 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNHIT3Q15649 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNHIT3Q15649 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNHIT3Q15649 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNHIT3Q15649 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNHIT3Q15649 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNHIT3Q15649 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNHIT3Q15649 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNHIT3Q15649 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNHIT3Q15649 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNHIT3Q15649 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNHIT3Q15649 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNHIT3Q15649 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNHIT3Q15649 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNHIT3Q15649 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNHIT3Q15649 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNHIT3Q15649 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZNHIT3Q15649 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZNHIT3Q15649 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZNHIT3Q15649 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZNHIT3Q15649 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNHIT3Q15649 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNHIT3Q15649 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNHIT3Q15649 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNHIT3Q15649 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNHIT3Q15649 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNHIT3Q15649 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNHIT3Q15649 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNHIT3Q15649 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNHIT3Q15649 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNHIT3Q15649 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNHIT3Q15649 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNHIT3Q15649 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNHIT3Q15649 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNHIT3Q15649 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNHIT3Q15649 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNHIT3Q15649 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNHIT3Q15649 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNHIT3Q15649 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNHIT3Q15649 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNHIT3Q15649 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNHIT3Q15649 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNHIT3Q15649 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNHIT3Q15649 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNHIT3Q15649 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNHIT3Q15649 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNHIT3Q15649 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNHIT3Q15649 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNHIT3Q15649 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNHIT3Q15649 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNHIT3Q15649 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNHIT3Q15649 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNHIT3Q15649 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNHIT3Q15649 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNHIT3Q15649 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNHIT3Q15649 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNHIT3Q15649 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNHIT3Q15649 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNHIT3Q15649 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNHIT3Q15649 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNHIT3Q15649 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNHIT3Q15649 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNHIT3Q15649 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNHIT3Q15649 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
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