Protein–RNA interactions for Protein: Q15118

PDK1, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK1Q15118 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDK1Q15118 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDK1Q15118 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDK1Q15118 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDK1Q15118 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDK1Q15118 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDK1Q15118 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDK1Q15118 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDK1Q15118 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDK1Q15118 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDK1Q15118 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDK1Q15118 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDK1Q15118 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDK1Q15118 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDK1Q15118 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDK1Q15118 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDK1Q15118 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDK1Q15118 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDK1Q15118 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDK1Q15118 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDK1Q15118 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDK1Q15118 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PDK1Q15118 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDK1Q15118 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PDK1Q15118 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PDK1Q15118 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDK1Q15118 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDK1Q15118 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDK1Q15118 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDK1Q15118 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PDK1Q15118 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDK1Q15118 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDK1Q15118 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDK1Q15118 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PDK1Q15118 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDK1Q15118 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDK1Q15118 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDK1Q15118 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDK1Q15118 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDK1Q15118 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDK1Q15118 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDK1Q15118 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDK1Q15118 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDK1Q15118 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDK1Q15118 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDK1Q15118 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDK1Q15118 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDK1Q15118 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDK1Q15118 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDK1Q15118 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDK1Q15118 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDK1Q15118 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDK1Q15118 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDK1Q15118 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDK1Q15118 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDK1Q15118 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDK1Q15118 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDK1Q15118 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDK1Q15118 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDK1Q15118 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDK1Q15118 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDK1Q15118 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDK1Q15118 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDK1Q15118 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PDK1Q15118 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDK1Q15118 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDK1Q15118 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDK1Q15118 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDK1Q15118 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDK1Q15118 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDK1Q15118 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDK1Q15118 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDK1Q15118 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDK1Q15118 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDK1Q15118 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDK1Q15118 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDK1Q15118 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDK1Q15118 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDK1Q15118 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDK1Q15118 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDK1Q15118 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDK1Q15118 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDK1Q15118 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDK1Q15118 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDK1Q15118 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDK1Q15118 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDK1Q15118 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDK1Q15118 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDK1Q15118 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDK1Q15118 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDK1Q15118 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDK1Q15118 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDK1Q15118 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDK1Q15118 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDK1Q15118 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PDK1Q15118 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDK1Q15118 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDK1Q15118 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDK1Q15118 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDK1Q15118 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms