Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

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Length 389 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSMD6Q15008 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSMD6Q15008 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSMD6Q15008 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSMD6Q15008 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSMD6Q15008 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSMD6Q15008 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSMD6Q15008 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSMD6Q15008 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSMD6Q15008 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PSMD6Q15008 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSMD6Q15008 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSMD6Q15008 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSMD6Q15008 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSMD6Q15008 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSMD6Q15008 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSMD6Q15008 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSMD6Q15008 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSMD6Q15008 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PSMD6Q15008 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSMD6Q15008 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSMD6Q15008 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSMD6Q15008 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSMD6Q15008 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSMD6Q15008 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSMD6Q15008 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PSMD6Q15008 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSMD6Q15008 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSMD6Q15008 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSMD6Q15008 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSMD6Q15008 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSMD6Q15008 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSMD6Q15008 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSMD6Q15008 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSMD6Q15008 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSMD6Q15008 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSMD6Q15008 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSMD6Q15008 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSMD6Q15008 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSMD6Q15008 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSMD6Q15008 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSMD6Q15008 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSMD6Q15008 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSMD6Q15008 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PSMD6Q15008 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSMD6Q15008 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSMD6Q15008 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSMD6Q15008 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSMD6Q15008 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSMD6Q15008 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSMD6Q15008 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSMD6Q15008 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSMD6Q15008 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSMD6Q15008 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSMD6Q15008 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PSMD6Q15008 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PSMD6Q15008 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PSMD6Q15008 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PSMD6Q15008 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PSMD6Q15008 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PSMD6Q15008 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PSMD6Q15008 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PSMD6Q15008 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PSMD6Q15008 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSMD6Q15008 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSMD6Q15008 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PSMD6Q15008 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSMD6Q15008 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSMD6Q15008 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSMD6Q15008 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSMD6Q15008 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMD6Q15008 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMD6Q15008 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMD6Q15008 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMD6Q15008 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMD6Q15008 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMD6Q15008 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMD6Q15008 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMD6Q15008 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSMD6Q15008 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSMD6Q15008 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSMD6Q15008 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PSMD6Q15008 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSMD6Q15008 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSMD6Q15008 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSMD6Q15008 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSMD6Q15008 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSMD6Q15008 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSMD6Q15008 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSMD6Q15008 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSMD6Q15008 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSMD6Q15008 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSMD6Q15008 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSMD6Q15008 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSMD6Q15008 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSMD6Q15008 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSMD6Q15008 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSMD6Q15008 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSMD6Q15008 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSMD6Q15008 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
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