Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GPNMBQ14956 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
GPNMBQ14956 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GPNMBQ14956 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GPNMBQ14956 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GPNMBQ14956 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GPNMBQ14956 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GPNMBQ14956 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GPNMBQ14956 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GPNMBQ14956 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GPNMBQ14956 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GPNMBQ14956 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GPNMBQ14956 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GPNMBQ14956 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GPNMBQ14956 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GPNMBQ14956 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GPNMBQ14956 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GPNMBQ14956 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GPNMBQ14956 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GPNMBQ14956 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GPNMBQ14956 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GPNMBQ14956 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GPNMBQ14956 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GPNMBQ14956 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GPNMBQ14956 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
GPNMBQ14956 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GPNMBQ14956 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GPNMBQ14956 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GPNMBQ14956 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GPNMBQ14956 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GPNMBQ14956 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GPNMBQ14956 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GPNMBQ14956 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GPNMBQ14956 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GPNMBQ14956 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
GPNMBQ14956 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GPNMBQ14956 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GPNMBQ14956 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GPNMBQ14956 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GPNMBQ14956 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GPNMBQ14956 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GPNMBQ14956 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GPNMBQ14956 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GPNMBQ14956 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GPNMBQ14956 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GPNMBQ14956 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GPNMBQ14956 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GPNMBQ14956 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GPNMBQ14956 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GPNMBQ14956 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GPNMBQ14956 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
GPNMBQ14956 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
GPNMBQ14956 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GPNMBQ14956 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GPNMBQ14956 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GPNMBQ14956 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GPNMBQ14956 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GPNMBQ14956 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GPNMBQ14956 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GPNMBQ14956 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GPNMBQ14956 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GPNMBQ14956 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GPNMBQ14956 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GPNMBQ14956 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GPNMBQ14956 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GPNMBQ14956 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GPNMBQ14956 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GPNMBQ14956 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GPNMBQ14956 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GPNMBQ14956 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
GPNMBQ14956 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GPNMBQ14956 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GPNMBQ14956 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GPNMBQ14956 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GPNMBQ14956 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GPNMBQ14956 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GPNMBQ14956 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GPNMBQ14956 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GPNMBQ14956 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPNMBQ14956 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPNMBQ14956 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPNMBQ14956 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPNMBQ14956 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPNMBQ14956 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPNMBQ14956 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GPNMBQ14956 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GPNMBQ14956 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GPNMBQ14956 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GPNMBQ14956 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GPNMBQ14956 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GPNMBQ14956 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GPNMBQ14956 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GPNMBQ14956 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GPNMBQ14956 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GPNMBQ14956 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GPNMBQ14956 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GPNMBQ14956 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GPNMBQ14956 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GPNMBQ14956 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GPNMBQ14956 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
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