Protein–RNA interactions for Protein: Q13905

RAPGEF1, Rap guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,077 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF1Q13905 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAPGEF1Q13905 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAPGEF1Q13905 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAPGEF1Q13905 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAPGEF1Q13905 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAPGEF1Q13905 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAPGEF1Q13905 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAPGEF1Q13905 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAPGEF1Q13905 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RAPGEF1Q13905 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAPGEF1Q13905 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAPGEF1Q13905 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAPGEF1Q13905 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAPGEF1Q13905 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAPGEF1Q13905 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAPGEF1Q13905 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAPGEF1Q13905 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAPGEF1Q13905 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAPGEF1Q13905 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAPGEF1Q13905 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAPGEF1Q13905 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAPGEF1Q13905 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAPGEF1Q13905 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAPGEF1Q13905 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAPGEF1Q13905 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAPGEF1Q13905 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAPGEF1Q13905 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RAPGEF1Q13905 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAPGEF1Q13905 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAPGEF1Q13905 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAPGEF1Q13905 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAPGEF1Q13905 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAPGEF1Q13905 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAPGEF1Q13905 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAPGEF1Q13905 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAPGEF1Q13905 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAPGEF1Q13905 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAPGEF1Q13905 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAPGEF1Q13905 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAPGEF1Q13905 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAPGEF1Q13905 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAPGEF1Q13905 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RAPGEF1Q13905 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAPGEF1Q13905 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAPGEF1Q13905 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAPGEF1Q13905 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAPGEF1Q13905 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAPGEF1Q13905 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAPGEF1Q13905 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAPGEF1Q13905 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAPGEF1Q13905 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RAPGEF1Q13905 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAPGEF1Q13905 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAPGEF1Q13905 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAPGEF1Q13905 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAPGEF1Q13905 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAPGEF1Q13905 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAPGEF1Q13905 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAPGEF1Q13905 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAPGEF1Q13905 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAPGEF1Q13905 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAPGEF1Q13905 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAPGEF1Q13905 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAPGEF1Q13905 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RAPGEF1Q13905 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAPGEF1Q13905 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAPGEF1Q13905 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAPGEF1Q13905 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAPGEF1Q13905 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAPGEF1Q13905 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAPGEF1Q13905 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAPGEF1Q13905 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAPGEF1Q13905 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAPGEF1Q13905 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RAPGEF1Q13905 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAPGEF1Q13905 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAPGEF1Q13905 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAPGEF1Q13905 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAPGEF1Q13905 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAPGEF1Q13905 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAPGEF1Q13905 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAPGEF1Q13905 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAPGEF1Q13905 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAPGEF1Q13905 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAPGEF1Q13905 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAPGEF1Q13905 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAPGEF1Q13905 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAPGEF1Q13905 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAPGEF1Q13905 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAPGEF1Q13905 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAPGEF1Q13905 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAPGEF1Q13905 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAPGEF1Q13905 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RAPGEF1Q13905 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAPGEF1Q13905 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAPGEF1Q13905 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAPGEF1Q13905 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RAPGEF1Q13905 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RAPGEF1Q13905 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAPGEF1Q13905 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
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