Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NFX1Q12986 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NFX1Q12986 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NFX1Q12986 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NFX1Q12986 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NFX1Q12986 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NFX1Q12986 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NFX1Q12986 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NFX1Q12986 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NFX1Q12986 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NFX1Q12986 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NFX1Q12986 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NFX1Q12986 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NFX1Q12986 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NFX1Q12986 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NFX1Q12986 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NFX1Q12986 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NFX1Q12986 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NFX1Q12986 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NFX1Q12986 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NFX1Q12986 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NFX1Q12986 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NFX1Q12986 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NFX1Q12986 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
NFX1Q12986 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NFX1Q12986 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NFX1Q12986 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
NFX1Q12986 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NFX1Q12986 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NFX1Q12986 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NFX1Q12986 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NFX1Q12986 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NFX1Q12986 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NFX1Q12986 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NFX1Q12986 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NFX1Q12986 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NFX1Q12986 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NFX1Q12986 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NFX1Q12986 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NFX1Q12986 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NFX1Q12986 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NFX1Q12986 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NFX1Q12986 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NFX1Q12986 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NFX1Q12986 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NFX1Q12986 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NFX1Q12986 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NFX1Q12986 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NFX1Q12986 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NFX1Q12986 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NFX1Q12986 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NFX1Q12986 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NFX1Q12986 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NFX1Q12986 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NFX1Q12986 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NFX1Q12986 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NFX1Q12986 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NFX1Q12986 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NFX1Q12986 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NFX1Q12986 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NFX1Q12986 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NFX1Q12986 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NFX1Q12986 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NFX1Q12986 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NFX1Q12986 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NFX1Q12986 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NFX1Q12986 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NFX1Q12986 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NFX1Q12986 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NFX1Q12986 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NFX1Q12986 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NFX1Q12986 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NFX1Q12986 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NFX1Q12986 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NFX1Q12986 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NFX1Q12986 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NFX1Q12986 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NFX1Q12986 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NFX1Q12986 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NFX1Q12986 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NFX1Q12986 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NFX1Q12986 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NFX1Q12986 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NFX1Q12986 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NFX1Q12986 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NFX1Q12986 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NFX1Q12986 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NFX1Q12986 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NFX1Q12986 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NFX1Q12986 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NFX1Q12986 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NFX1Q12986 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NFX1Q12986 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NFX1Q12986 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NFX1Q12986 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NFX1Q12986 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NFX1Q12986 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NFX1Q12986 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NFX1Q12986 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NFX1Q12986 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms