Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RAB40BQ12829 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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RAB40BQ12829 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
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RAB40BQ12829 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RAB40BQ12829 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
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RAB40BQ12829 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
RAB40BQ12829 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
RAB40BQ12829 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RAB40BQ12829 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RAB40BQ12829 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RAB40BQ12829 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RAB40BQ12829 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RAB40BQ12829 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RAB40BQ12829 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RAB40BQ12829 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RAB40BQ12829 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RAB40BQ12829 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
RAB40BQ12829 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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