Protein–RNA interactions for Protein: Q08AH3

ACSM2A, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM2AQ08AH3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACSM2AQ08AH3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACSM2AQ08AH3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACSM2AQ08AH3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACSM2AQ08AH3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ACSM2AQ08AH3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACSM2AQ08AH3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ACSM2AQ08AH3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACSM2AQ08AH3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACSM2AQ08AH3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACSM2AQ08AH3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACSM2AQ08AH3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACSM2AQ08AH3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACSM2AQ08AH3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACSM2AQ08AH3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACSM2AQ08AH3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACSM2AQ08AH3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACSM2AQ08AH3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACSM2AQ08AH3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACSM2AQ08AH3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACSM2AQ08AH3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACSM2AQ08AH3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACSM2AQ08AH3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACSM2AQ08AH3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACSM2AQ08AH3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACSM2AQ08AH3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACSM2AQ08AH3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACSM2AQ08AH3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACSM2AQ08AH3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACSM2AQ08AH3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACSM2AQ08AH3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACSM2AQ08AH3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACSM2AQ08AH3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACSM2AQ08AH3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACSM2AQ08AH3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACSM2AQ08AH3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACSM2AQ08AH3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACSM2AQ08AH3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACSM2AQ08AH3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACSM2AQ08AH3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACSM2AQ08AH3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACSM2AQ08AH3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACSM2AQ08AH3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACSM2AQ08AH3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACSM2AQ08AH3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACSM2AQ08AH3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ACSM2AQ08AH3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACSM2AQ08AH3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ACSM2AQ08AH3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACSM2AQ08AH3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACSM2AQ08AH3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACSM2AQ08AH3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACSM2AQ08AH3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACSM2AQ08AH3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACSM2AQ08AH3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACSM2AQ08AH3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACSM2AQ08AH3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACSM2AQ08AH3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACSM2AQ08AH3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACSM2AQ08AH3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACSM2AQ08AH3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACSM2AQ08AH3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACSM2AQ08AH3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ACSM2AQ08AH3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACSM2AQ08AH3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACSM2AQ08AH3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACSM2AQ08AH3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACSM2AQ08AH3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACSM2AQ08AH3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACSM2AQ08AH3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACSM2AQ08AH3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACSM2AQ08AH3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACSM2AQ08AH3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACSM2AQ08AH3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACSM2AQ08AH3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACSM2AQ08AH3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACSM2AQ08AH3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACSM2AQ08AH3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACSM2AQ08AH3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACSM2AQ08AH3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACSM2AQ08AH3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACSM2AQ08AH3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACSM2AQ08AH3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACSM2AQ08AH3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACSM2AQ08AH3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACSM2AQ08AH3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACSM2AQ08AH3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACSM2AQ08AH3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACSM2AQ08AH3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACSM2AQ08AH3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACSM2AQ08AH3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACSM2AQ08AH3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACSM2AQ08AH3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACSM2AQ08AH3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACSM2AQ08AH3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACSM2AQ08AH3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACSM2AQ08AH3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACSM2AQ08AH3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACSM2AQ08AH3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACSM2AQ08AH3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms