Protein–RNA interactions for Protein: Q07912

TNK2, Activated CDC42 kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNK2Q07912 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNK2Q07912 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNK2Q07912 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNK2Q07912 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNK2Q07912 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNK2Q07912 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNK2Q07912 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNK2Q07912 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TNK2Q07912 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNK2Q07912 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNK2Q07912 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNK2Q07912 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNK2Q07912 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNK2Q07912 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNK2Q07912 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNK2Q07912 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNK2Q07912 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNK2Q07912 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNK2Q07912 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNK2Q07912 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNK2Q07912 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNK2Q07912 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNK2Q07912 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TNK2Q07912 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNK2Q07912 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNK2Q07912 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNK2Q07912 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNK2Q07912 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNK2Q07912 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNK2Q07912 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TNK2Q07912 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNK2Q07912 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNK2Q07912 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNK2Q07912 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNK2Q07912 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNK2Q07912 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNK2Q07912 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNK2Q07912 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNK2Q07912 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNK2Q07912 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNK2Q07912 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNK2Q07912 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNK2Q07912 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNK2Q07912 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNK2Q07912 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNK2Q07912 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNK2Q07912 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNK2Q07912 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNK2Q07912 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNK2Q07912 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNK2Q07912 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNK2Q07912 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNK2Q07912 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNK2Q07912 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNK2Q07912 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNK2Q07912 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNK2Q07912 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNK2Q07912 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TNK2Q07912 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNK2Q07912 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNK2Q07912 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNK2Q07912 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNK2Q07912 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNK2Q07912 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNK2Q07912 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNK2Q07912 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNK2Q07912 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNK2Q07912 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNK2Q07912 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNK2Q07912 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNK2Q07912 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNK2Q07912 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNK2Q07912 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNK2Q07912 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TNK2Q07912 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNK2Q07912 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TNK2Q07912 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TNK2Q07912 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TNK2Q07912 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNK2Q07912 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNK2Q07912 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNK2Q07912 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNK2Q07912 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNK2Q07912 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNK2Q07912 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNK2Q07912 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNK2Q07912 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNK2Q07912 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNK2Q07912 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNK2Q07912 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNK2Q07912 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNK2Q07912 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TNK2Q07912 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TNK2Q07912 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TNK2Q07912 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNK2Q07912 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNK2Q07912 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TNK2Q07912 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TNK2Q07912 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNK2Q07912 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms