Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNP2Q05952 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNP2Q05952 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNP2Q05952 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNP2Q05952 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNP2Q05952 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNP2Q05952 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TNP2Q05952 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNP2Q05952 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNP2Q05952 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TNP2Q05952 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNP2Q05952 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNP2Q05952 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TNP2Q05952 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNP2Q05952 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNP2Q05952 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNP2Q05952 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNP2Q05952 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNP2Q05952 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNP2Q05952 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNP2Q05952 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNP2Q05952 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNP2Q05952 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TNP2Q05952 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNP2Q05952 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNP2Q05952 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNP2Q05952 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNP2Q05952 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNP2Q05952 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNP2Q05952 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNP2Q05952 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNP2Q05952 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNP2Q05952 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNP2Q05952 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNP2Q05952 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNP2Q05952 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNP2Q05952 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNP2Q05952 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNP2Q05952 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNP2Q05952 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TNP2Q05952 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNP2Q05952 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNP2Q05952 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNP2Q05952 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNP2Q05952 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNP2Q05952 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNP2Q05952 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TNP2Q05952 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNP2Q05952 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNP2Q05952 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNP2Q05952 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNP2Q05952 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNP2Q05952 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNP2Q05952 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNP2Q05952 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNP2Q05952 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TNP2Q05952 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNP2Q05952 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNP2Q05952 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNP2Q05952 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNP2Q05952 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNP2Q05952 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNP2Q05952 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNP2Q05952 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNP2Q05952 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNP2Q05952 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TNP2Q05952 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNP2Q05952 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNP2Q05952 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNP2Q05952 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNP2Q05952 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNP2Q05952 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNP2Q05952 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TNP2Q05952 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNP2Q05952 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNP2Q05952 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNP2Q05952 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TNP2Q05952 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNP2Q05952 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNP2Q05952 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNP2Q05952 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNP2Q05952 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TNP2Q05952 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNP2Q05952 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNP2Q05952 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNP2Q05952 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNP2Q05952 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNP2Q05952 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNP2Q05952 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNP2Q05952 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNP2Q05952 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNP2Q05952 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TNP2Q05952 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNP2Q05952 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNP2Q05952 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNP2Q05952 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNP2Q05952 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TNP2Q05952 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TNP2Q05952 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNP2Q05952 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms