Protein–RNA interactions for Protein: P59037

LINC00313, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00313, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00313P59037 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00313P59037 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00313P59037 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00313P59037 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00313P59037 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00313P59037 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00313P59037 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00313P59037 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00313P59037 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00313P59037 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00313P59037 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00313P59037 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00313P59037 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00313P59037 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00313P59037 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00313P59037 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00313P59037 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00313P59037 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00313P59037 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00313P59037 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00313P59037 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00313P59037 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00313P59037 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00313P59037 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00313P59037 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00313P59037 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00313P59037 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00313P59037 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00313P59037 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00313P59037 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00313P59037 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00313P59037 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00313P59037 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00313P59037 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00313P59037 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00313P59037 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00313P59037 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00313P59037 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00313P59037 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00313P59037 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00313P59037 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00313P59037 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00313P59037 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00313P59037 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00313P59037 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00313P59037 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00313P59037 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00313P59037 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00313P59037 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00313P59037 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00313P59037 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00313P59037 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00313P59037 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00313P59037 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00313P59037 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00313P59037 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00313P59037 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00313P59037 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00313P59037 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00313P59037 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00313P59037 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00313P59037 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00313P59037 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00313P59037 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00313P59037 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00313P59037 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00313P59037 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00313P59037 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00313P59037 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00313P59037 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00313P59037 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00313P59037 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00313P59037 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00313P59037 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00313P59037 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00313P59037 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00313P59037 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00313P59037 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00313P59037 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00313P59037 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00313P59037 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00313P59037 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00313P59037 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00313P59037 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00313P59037 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00313P59037 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00313P59037 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00313P59037 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00313P59037 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00313P59037 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00313P59037 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00313P59037 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00313P59037 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00313P59037 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00313P59037 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00313P59037 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00313P59037 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00313P59037 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00313P59037 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00313P59037 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms