Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EPHB4P54760 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EPHB4P54760 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EPHB4P54760 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EPHB4P54760 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EPHB4P54760 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EPHB4P54760 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EPHB4P54760 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EPHB4P54760 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EPHB4P54760 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EPHB4P54760 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EPHB4P54760 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EPHB4P54760 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EPHB4P54760 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EPHB4P54760 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EPHB4P54760 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EPHB4P54760 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EPHB4P54760 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EPHB4P54760 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
EPHB4P54760 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EPHB4P54760 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EPHB4P54760 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EPHB4P54760 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EPHB4P54760 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EPHB4P54760 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EPHB4P54760 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EPHB4P54760 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EPHB4P54760 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EPHB4P54760 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EPHB4P54760 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EPHB4P54760 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
EPHB4P54760 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EPHB4P54760 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EPHB4P54760 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EPHB4P54760 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EPHB4P54760 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EPHB4P54760 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EPHB4P54760 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EPHB4P54760 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EPHB4P54760 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EPHB4P54760 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EPHB4P54760 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EPHB4P54760 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EPHB4P54760 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EPHB4P54760 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EPHB4P54760 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EPHB4P54760 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EPHB4P54760 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EPHB4P54760 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EPHB4P54760 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EPHB4P54760 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EPHB4P54760 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EPHB4P54760 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EPHB4P54760 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
EPHB4P54760 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EPHB4P54760 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EPHB4P54760 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
EPHB4P54760 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
EPHB4P54760 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26■■□□□ 1.75
EPHB4P54760 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EPHB4P54760 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EPHB4P54760 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EPHB4P54760 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EPHB4P54760 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EPHB4P54760 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EPHB4P54760 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EPHB4P54760 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
EPHB4P54760 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EPHB4P54760 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EPHB4P54760 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EPHB4P54760 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
EPHB4P54760 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EPHB4P54760 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EPHB4P54760 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EPHB4P54760 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EPHB4P54760 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EPHB4P54760 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EPHB4P54760 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EPHB4P54760 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EPHB4P54760 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EPHB4P54760 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EPHB4P54760 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EPHB4P54760 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EPHB4P54760 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
EPHB4P54760 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
EPHB4P54760 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
EPHB4P54760 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EPHB4P54760 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EPHB4P54760 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EPHB4P54760 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EPHB4P54760 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
EPHB4P54760 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
EPHB4P54760 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EPHB4P54760 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
EPHB4P54760 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
EPHB4P54760 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EPHB4P54760 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
EPHB4P54760 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
EPHB4P54760 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
EPHB4P54760 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms