Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP12AP54707 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP12AP54707 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP12AP54707 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP12AP54707 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP12AP54707 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP12AP54707 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP12AP54707 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP12AP54707 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP12AP54707 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP12AP54707 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP12AP54707 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP12AP54707 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP12AP54707 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP12AP54707 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP12AP54707 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP12AP54707 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP12AP54707 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP12AP54707 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP12AP54707 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP12AP54707 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP12AP54707 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP12AP54707 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP12AP54707 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP12AP54707 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP12AP54707 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP12AP54707 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP12AP54707 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP12AP54707 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP12AP54707 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP12AP54707 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP12AP54707 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ATP12AP54707 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ATP12AP54707 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP12AP54707 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP12AP54707 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP12AP54707 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP12AP54707 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP12AP54707 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP12AP54707 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP12AP54707 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP12AP54707 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP12AP54707 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP12AP54707 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP12AP54707 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP12AP54707 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP12AP54707 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP12AP54707 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP12AP54707 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP12AP54707 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP12AP54707 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP12AP54707 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP12AP54707 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP12AP54707 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP12AP54707 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP12AP54707 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP12AP54707 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP12AP54707 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP12AP54707 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP12AP54707 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP12AP54707 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP12AP54707 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP12AP54707 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP12AP54707 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP12AP54707 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP12AP54707 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP12AP54707 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP12AP54707 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP12AP54707 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP12AP54707 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP12AP54707 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP12AP54707 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP12AP54707 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP12AP54707 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP12AP54707 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP12AP54707 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP12AP54707 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP12AP54707 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP12AP54707 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP12AP54707 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP12AP54707 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP12AP54707 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP12AP54707 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP12AP54707 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP12AP54707 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP12AP54707 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP12AP54707 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP12AP54707 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP12AP54707 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP12AP54707 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP12AP54707 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP12AP54707 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP12AP54707 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP12AP54707 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP12AP54707 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP12AP54707 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP12AP54707 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP12AP54707 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP12AP54707 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP12AP54707 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms