Protein–RNA interactions for Protein: P54107

CRISP1, Cysteine-rich secretory protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP1P54107 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CRISP1P54107 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CRISP1P54107 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CRISP1P54107 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CRISP1P54107 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CRISP1P54107 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CRISP1P54107 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CRISP1P54107 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CRISP1P54107 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CRISP1P54107 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CRISP1P54107 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CRISP1P54107 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CRISP1P54107 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRISP1P54107 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRISP1P54107 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRISP1P54107 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRISP1P54107 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRISP1P54107 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRISP1P54107 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRISP1P54107 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRISP1P54107 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRISP1P54107 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRISP1P54107 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRISP1P54107 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRISP1P54107 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRISP1P54107 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRISP1P54107 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRISP1P54107 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRISP1P54107 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRISP1P54107 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CRISP1P54107 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRISP1P54107 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRISP1P54107 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRISP1P54107 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRISP1P54107 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRISP1P54107 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRISP1P54107 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRISP1P54107 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CRISP1P54107 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRISP1P54107 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRISP1P54107 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRISP1P54107 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRISP1P54107 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRISP1P54107 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRISP1P54107 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRISP1P54107 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRISP1P54107 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRISP1P54107 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRISP1P54107 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRISP1P54107 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRISP1P54107 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRISP1P54107 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRISP1P54107 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRISP1P54107 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRISP1P54107 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRISP1P54107 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRISP1P54107 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRISP1P54107 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRISP1P54107 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRISP1P54107 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CRISP1P54107 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CRISP1P54107 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRISP1P54107 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CRISP1P54107 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CRISP1P54107 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CRISP1P54107 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CRISP1P54107 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRISP1P54107 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRISP1P54107 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRISP1P54107 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRISP1P54107 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRISP1P54107 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CRISP1P54107 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRISP1P54107 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRISP1P54107 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRISP1P54107 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRISP1P54107 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRISP1P54107 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRISP1P54107 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRISP1P54107 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRISP1P54107 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRISP1P54107 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRISP1P54107 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CRISP1P54107 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CRISP1P54107 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CRISP1P54107 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CRISP1P54107 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CRISP1P54107 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CRISP1P54107 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CRISP1P54107 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CRISP1P54107 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CRISP1P54107 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CRISP1P54107 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CRISP1P54107 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CRISP1P54107 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CRISP1P54107 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CRISP1P54107 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CRISP1P54107 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CRISP1P54107 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CRISP1P54107 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms