Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FOSBP53539 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FOSBP53539 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FOSBP53539 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FOSBP53539 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FOSBP53539 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FOSBP53539 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FOSBP53539 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FOSBP53539 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FOSBP53539 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FOSBP53539 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FOSBP53539 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
FOSBP53539 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
FOSBP53539 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FOSBP53539 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FOSBP53539 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FOSBP53539 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FOSBP53539 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FOSBP53539 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
FOSBP53539 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FOSBP53539 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
FOSBP53539 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FOSBP53539 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FOSBP53539 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FOSBP53539 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FOSBP53539 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
FOSBP53539 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FOSBP53539 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FOSBP53539 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FOSBP53539 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
FOSBP53539 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FOSBP53539 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FOSBP53539 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FOSBP53539 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FOSBP53539 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
FOSBP53539 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FOSBP53539 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FOSBP53539 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FOSBP53539 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FOSBP53539 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FOSBP53539 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FOSBP53539 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FOSBP53539 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FOSBP53539 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FOSBP53539 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FOSBP53539 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
FOSBP53539 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FOSBP53539 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FOSBP53539 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FOSBP53539 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FOSBP53539 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FOSBP53539 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FOSBP53539 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FOSBP53539 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FOSBP53539 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FOSBP53539 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FOSBP53539 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FOSBP53539 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FOSBP53539 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FOSBP53539 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FOSBP53539 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FOSBP53539 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FOSBP53539 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FOSBP53539 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FOSBP53539 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FOSBP53539 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
FOSBP53539 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
FOSBP53539 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
FOSBP53539 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
FOSBP53539 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
FOSBP53539 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
FOSBP53539 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FOSBP53539 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FOSBP53539 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FOSBP53539 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FOSBP53539 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FOSBP53539 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FOSBP53539 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FOSBP53539 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
FOSBP53539 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FOSBP53539 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FOSBP53539 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FOSBP53539 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FOSBP53539 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FOSBP53539 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FOSBP53539 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FOSBP53539 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FOSBP53539 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FOSBP53539 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FOSBP53539 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FOSBP53539 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FOSBP53539 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FOSBP53539 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FOSBP53539 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
FOSBP53539 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FOSBP53539 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FOSBP53539 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FOSBP53539 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FOSBP53539 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FOSBP53539 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms