Protein–RNA interactions for Protein: P51955

NEK2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK2P51955 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEK2P51955 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NEK2P51955 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEK2P51955 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEK2P51955 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEK2P51955 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEK2P51955 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEK2P51955 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEK2P51955 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEK2P51955 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEK2P51955 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEK2P51955 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEK2P51955 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEK2P51955 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEK2P51955 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEK2P51955 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEK2P51955 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEK2P51955 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEK2P51955 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEK2P51955 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEK2P51955 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEK2P51955 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEK2P51955 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEK2P51955 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEK2P51955 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEK2P51955 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEK2P51955 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEK2P51955 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEK2P51955 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEK2P51955 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEK2P51955 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEK2P51955 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEK2P51955 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NEK2P51955 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEK2P51955 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEK2P51955 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEK2P51955 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEK2P51955 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEK2P51955 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEK2P51955 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEK2P51955 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEK2P51955 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEK2P51955 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEK2P51955 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEK2P51955 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEK2P51955 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEK2P51955 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEK2P51955 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEK2P51955 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEK2P51955 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEK2P51955 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEK2P51955 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEK2P51955 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEK2P51955 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEK2P51955 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEK2P51955 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEK2P51955 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NEK2P51955 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NEK2P51955 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEK2P51955 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEK2P51955 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEK2P51955 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEK2P51955 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEK2P51955 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEK2P51955 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEK2P51955 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEK2P51955 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEK2P51955 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEK2P51955 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEK2P51955 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEK2P51955 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEK2P51955 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEK2P51955 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEK2P51955 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEK2P51955 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEK2P51955 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEK2P51955 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEK2P51955 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEK2P51955 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEK2P51955 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEK2P51955 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEK2P51955 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEK2P51955 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEK2P51955 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEK2P51955 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEK2P51955 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEK2P51955 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NEK2P51955 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEK2P51955 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NEK2P51955 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NEK2P51955 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NEK2P51955 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NEK2P51955 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NEK2P51955 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEK2P51955 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEK2P51955 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEK2P51955 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEK2P51955 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEK2P51955 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEK2P51955 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms