Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GSK3BP49841 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GSK3BP49841 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GSK3BP49841 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GSK3BP49841 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GSK3BP49841 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GSK3BP49841 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GSK3BP49841 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GSK3BP49841 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GSK3BP49841 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GSK3BP49841 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GSK3BP49841 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GSK3BP49841 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GSK3BP49841 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GSK3BP49841 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GSK3BP49841 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GSK3BP49841 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GSK3BP49841 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GSK3BP49841 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GSK3BP49841 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GSK3BP49841 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GSK3BP49841 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GSK3BP49841 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GSK3BP49841 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GSK3BP49841 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GSK3BP49841 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GSK3BP49841 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GSK3BP49841 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GSK3BP49841 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GSK3BP49841 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GSK3BP49841 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GSK3BP49841 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GSK3BP49841 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GSK3BP49841 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GSK3BP49841 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GSK3BP49841 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GSK3BP49841 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GSK3BP49841 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GSK3BP49841 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GSK3BP49841 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GSK3BP49841 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GSK3BP49841 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GSK3BP49841 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GSK3BP49841 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GSK3BP49841 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
GSK3BP49841 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GSK3BP49841 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GSK3BP49841 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GSK3BP49841 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GSK3BP49841 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GSK3BP49841 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GSK3BP49841 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GSK3BP49841 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GSK3BP49841 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GSK3BP49841 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GSK3BP49841 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GSK3BP49841 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GSK3BP49841 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GSK3BP49841 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GSK3BP49841 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GSK3BP49841 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GSK3BP49841 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GSK3BP49841 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GSK3BP49841 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GSK3BP49841 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GSK3BP49841 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GSK3BP49841 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GSK3BP49841 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GSK3BP49841 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GSK3BP49841 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GSK3BP49841 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GSK3BP49841 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GSK3BP49841 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GSK3BP49841 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GSK3BP49841 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GSK3BP49841 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GSK3BP49841 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GSK3BP49841 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GSK3BP49841 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GSK3BP49841 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GSK3BP49841 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GSK3BP49841 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GSK3BP49841 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GSK3BP49841 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GSK3BP49841 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GSK3BP49841 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GSK3BP49841 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GSK3BP49841 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GSK3BP49841 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GSK3BP49841 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GSK3BP49841 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GSK3BP49841 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GSK3BP49841 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GSK3BP49841 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GSK3BP49841 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GSK3BP49841 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GSK3BP49841 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GSK3BP49841 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GSK3BP49841 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GSK3BP49841 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms