Protein–RNA interactions for Protein: P48960

CD97, CD97 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD97P48960 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD97P48960 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD97P48960 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD97P48960 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD97P48960 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD97P48960 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD97P48960 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD97P48960 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD97P48960 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD97P48960 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CD97P48960 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CD97P48960 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD97P48960 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD97P48960 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD97P48960 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CD97P48960 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD97P48960 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD97P48960 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD97P48960 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD97P48960 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD97P48960 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD97P48960 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD97P48960 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CD97P48960 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD97P48960 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD97P48960 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD97P48960 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD97P48960 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD97P48960 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD97P48960 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD97P48960 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD97P48960 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD97P48960 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD97P48960 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD97P48960 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CD97P48960 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD97P48960 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD97P48960 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD97P48960 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD97P48960 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD97P48960 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD97P48960 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD97P48960 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD97P48960 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD97P48960 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD97P48960 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD97P48960 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD97P48960 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD97P48960 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CD97P48960 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD97P48960 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD97P48960 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD97P48960 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD97P48960 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CD97P48960 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD97P48960 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD97P48960 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD97P48960 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD97P48960 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD97P48960 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CD97P48960 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CD97P48960 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD97P48960 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD97P48960 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD97P48960 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD97P48960 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD97P48960 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD97P48960 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CD97P48960 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CD97P48960 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD97P48960 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD97P48960 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CD97P48960 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD97P48960 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CD97P48960 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CD97P48960 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD97P48960 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD97P48960 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD97P48960 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD97P48960 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD97P48960 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD97P48960 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD97P48960 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD97P48960 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD97P48960 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD97P48960 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CD97P48960 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD97P48960 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD97P48960 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD97P48960 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD97P48960 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CD97P48960 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD97P48960 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD97P48960 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD97P48960 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD97P48960 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD97P48960 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD97P48960 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD97P48960 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD97P48960 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms