Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDF5P43026 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDF5P43026 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDF5P43026 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDF5P43026 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDF5P43026 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GDF5P43026 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GDF5P43026 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GDF5P43026 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GDF5P43026 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GDF5P43026 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GDF5P43026 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GDF5P43026 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GDF5P43026 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GDF5P43026 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GDF5P43026 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GDF5P43026 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GDF5P43026 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GDF5P43026 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GDF5P43026 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GDF5P43026 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GDF5P43026 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GDF5P43026 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GDF5P43026 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GDF5P43026 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GDF5P43026 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GDF5P43026 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GDF5P43026 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GDF5P43026 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GDF5P43026 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GDF5P43026 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GDF5P43026 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GDF5P43026 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GDF5P43026 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GDF5P43026 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDF5P43026 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDF5P43026 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GDF5P43026 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDF5P43026 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDF5P43026 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDF5P43026 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDF5P43026 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDF5P43026 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GDF5P43026 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GDF5P43026 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GDF5P43026 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GDF5P43026 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GDF5P43026 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GDF5P43026 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GDF5P43026 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GDF5P43026 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GDF5P43026 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GDF5P43026 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GDF5P43026 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GDF5P43026 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GDF5P43026 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GDF5P43026 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GDF5P43026 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GDF5P43026 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GDF5P43026 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GDF5P43026 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GDF5P43026 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GDF5P43026 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GDF5P43026 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GDF5P43026 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GDF5P43026 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GDF5P43026 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GDF5P43026 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GDF5P43026 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GDF5P43026 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GDF5P43026 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GDF5P43026 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GDF5P43026 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GDF5P43026 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GDF5P43026 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GDF5P43026 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GDF5P43026 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GDF5P43026 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GDF5P43026 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GDF5P43026 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GDF5P43026 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GDF5P43026 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GDF5P43026 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GDF5P43026 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GDF5P43026 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GDF5P43026 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GDF5P43026 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
GDF5P43026 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GDF5P43026 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GDF5P43026 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GDF5P43026 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GDF5P43026 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GDF5P43026 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GDF5P43026 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GDF5P43026 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GDF5P43026 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GDF5P43026 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GDF5P43026 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GDF5P43026 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GDF5P43026 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms