Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXD12P35452 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXD12P35452 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXD12P35452 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXD12P35452 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXD12P35452 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXD12P35452 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXD12P35452 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXD12P35452 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXD12P35452 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXD12P35452 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXD12P35452 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXD12P35452 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXD12P35452 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXD12P35452 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXD12P35452 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXD12P35452 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXD12P35452 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXD12P35452 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXD12P35452 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXD12P35452 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXD12P35452 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXD12P35452 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXD12P35452 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXD12P35452 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HOXD12P35452 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HOXD12P35452 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HOXD12P35452 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXD12P35452 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXD12P35452 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXD12P35452 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXD12P35452 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXD12P35452 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXD12P35452 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXD12P35452 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXD12P35452 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXD12P35452 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXD12P35452 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXD12P35452 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXD12P35452 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXD12P35452 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXD12P35452 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXD12P35452 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXD12P35452 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXD12P35452 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXD12P35452 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXD12P35452 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXD12P35452 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXD12P35452 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXD12P35452 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXD12P35452 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXD12P35452 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXD12P35452 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXD12P35452 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXD12P35452 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXD12P35452 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXD12P35452 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXD12P35452 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXD12P35452 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXD12P35452 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXD12P35452 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXD12P35452 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXD12P35452 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXD12P35452 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXD12P35452 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXD12P35452 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXD12P35452 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXD12P35452 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXD12P35452 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXD12P35452 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXD12P35452 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXD12P35452 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXD12P35452 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXD12P35452 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXD12P35452 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXD12P35452 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXD12P35452 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXD12P35452 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXD12P35452 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXD12P35452 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXD12P35452 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXD12P35452 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXD12P35452 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXD12P35452 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXD12P35452 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXD12P35452 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXD12P35452 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXD12P35452 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXD12P35452 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXD12P35452 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXD12P35452 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXD12P35452 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXD12P35452 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXD12P35452 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXD12P35452 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXD12P35452 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXD12P35452 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXD12P35452 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXD12P35452 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXD12P35452 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms