Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SFTPDP35247 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SFTPDP35247 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SFTPDP35247 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SFTPDP35247 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SFTPDP35247 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SFTPDP35247 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SFTPDP35247 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SFTPDP35247 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SFTPDP35247 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SFTPDP35247 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SFTPDP35247 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SFTPDP35247 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SFTPDP35247 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SFTPDP35247 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SFTPDP35247 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SFTPDP35247 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SFTPDP35247 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SFTPDP35247 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SFTPDP35247 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SFTPDP35247 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SFTPDP35247 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SFTPDP35247 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SFTPDP35247 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SFTPDP35247 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SFTPDP35247 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SFTPDP35247 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SFTPDP35247 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SFTPDP35247 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SFTPDP35247 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SFTPDP35247 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SFTPDP35247 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SFTPDP35247 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SFTPDP35247 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SFTPDP35247 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SFTPDP35247 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SFTPDP35247 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SFTPDP35247 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SFTPDP35247 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SFTPDP35247 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SFTPDP35247 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SFTPDP35247 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SFTPDP35247 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SFTPDP35247 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SFTPDP35247 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SFTPDP35247 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SFTPDP35247 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SFTPDP35247 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SFTPDP35247 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SFTPDP35247 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SFTPDP35247 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SFTPDP35247 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SFTPDP35247 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SFTPDP35247 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SFTPDP35247 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SFTPDP35247 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SFTPDP35247 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SFTPDP35247 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SFTPDP35247 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SFTPDP35247 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SFTPDP35247 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SFTPDP35247 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SFTPDP35247 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SFTPDP35247 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SFTPDP35247 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SFTPDP35247 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SFTPDP35247 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SFTPDP35247 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SFTPDP35247 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SFTPDP35247 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SFTPDP35247 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SFTPDP35247 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SFTPDP35247 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SFTPDP35247 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SFTPDP35247 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SFTPDP35247 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SFTPDP35247 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SFTPDP35247 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SFTPDP35247 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SFTPDP35247 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SFTPDP35247 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SFTPDP35247 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SFTPDP35247 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SFTPDP35247 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SFTPDP35247 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SFTPDP35247 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SFTPDP35247 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SFTPDP35247 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SFTPDP35247 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SFTPDP35247 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SFTPDP35247 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SFTPDP35247 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SFTPDP35247 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SFTPDP35247 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SFTPDP35247 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SFTPDP35247 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SFTPDP35247 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SFTPDP35247 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SFTPDP35247 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SFTPDP35247 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms