Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPC1P35052 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPC1P35052 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPC1P35052 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPC1P35052 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPC1P35052 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPC1P35052 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPC1P35052 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPC1P35052 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPC1P35052 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPC1P35052 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPC1P35052 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPC1P35052 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPC1P35052 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPC1P35052 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPC1P35052 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPC1P35052 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPC1P35052 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPC1P35052 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPC1P35052 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPC1P35052 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPC1P35052 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPC1P35052 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPC1P35052 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GPC1P35052 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GPC1P35052 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPC1P35052 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPC1P35052 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPC1P35052 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GPC1P35052 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GPC1P35052 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPC1P35052 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPC1P35052 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPC1P35052 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPC1P35052 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPC1P35052 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPC1P35052 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPC1P35052 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPC1P35052 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPC1P35052 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPC1P35052 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPC1P35052 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPC1P35052 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPC1P35052 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPC1P35052 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPC1P35052 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPC1P35052 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPC1P35052 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPC1P35052 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPC1P35052 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GPC1P35052 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPC1P35052 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GPC1P35052 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPC1P35052 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPC1P35052 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPC1P35052 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPC1P35052 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GPC1P35052 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPC1P35052 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPC1P35052 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPC1P35052 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPC1P35052 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPC1P35052 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPC1P35052 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPC1P35052 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPC1P35052 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPC1P35052 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GPC1P35052 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPC1P35052 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPC1P35052 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPC1P35052 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPC1P35052 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPC1P35052 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPC1P35052 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPC1P35052 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPC1P35052 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPC1P35052 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPC1P35052 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPC1P35052 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPC1P35052 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPC1P35052 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPC1P35052 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPC1P35052 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPC1P35052 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPC1P35052 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPC1P35052 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPC1P35052 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPC1P35052 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPC1P35052 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPC1P35052 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPC1P35052 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPC1P35052 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GPC1P35052 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPC1P35052 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPC1P35052 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPC1P35052 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPC1P35052 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPC1P35052 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPC1P35052 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPC1P35052 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms