Protein–RNA interactions for Protein: P29508

SERPINB3, Serpin B3, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINB3P29508 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SERPINB3P29508 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SERPINB3P29508 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SERPINB3P29508 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SERPINB3P29508 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SERPINB3P29508 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SERPINB3P29508 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SERPINB3P29508 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SERPINB3P29508 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SERPINB3P29508 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SERPINB3P29508 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SERPINB3P29508 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SERPINB3P29508 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SERPINB3P29508 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SERPINB3P29508 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SERPINB3P29508 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SERPINB3P29508 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SERPINB3P29508 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SERPINB3P29508 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SERPINB3P29508 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SERPINB3P29508 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SERPINB3P29508 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SERPINB3P29508 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SERPINB3P29508 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SERPINB3P29508 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SERPINB3P29508 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SERPINB3P29508 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SERPINB3P29508 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SERPINB3P29508 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SERPINB3P29508 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SERPINB3P29508 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SERPINB3P29508 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SERPINB3P29508 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SERPINB3P29508 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SERPINB3P29508 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SERPINB3P29508 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SERPINB3P29508 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SERPINB3P29508 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SERPINB3P29508 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SERPINB3P29508 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SERPINB3P29508 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SERPINB3P29508 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SERPINB3P29508 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SERPINB3P29508 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SERPINB3P29508 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SERPINB3P29508 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SERPINB3P29508 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SERPINB3P29508 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SERPINB3P29508 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SERPINB3P29508 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SERPINB3P29508 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SERPINB3P29508 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SERPINB3P29508 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SERPINB3P29508 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SERPINB3P29508 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SERPINB3P29508 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SERPINB3P29508 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SERPINB3P29508 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SERPINB3P29508 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SERPINB3P29508 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SERPINB3P29508 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SERPINB3P29508 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SERPINB3P29508 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SERPINB3P29508 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SERPINB3P29508 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SERPINB3P29508 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SERPINB3P29508 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SERPINB3P29508 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SERPINB3P29508 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SERPINB3P29508 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SERPINB3P29508 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SERPINB3P29508 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SERPINB3P29508 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SERPINB3P29508 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SERPINB3P29508 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SERPINB3P29508 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SERPINB3P29508 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SERPINB3P29508 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SERPINB3P29508 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SERPINB3P29508 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SERPINB3P29508 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SERPINB3P29508 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SERPINB3P29508 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SERPINB3P29508 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SERPINB3P29508 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SERPINB3P29508 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SERPINB3P29508 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SERPINB3P29508 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SERPINB3P29508 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SERPINB3P29508 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SERPINB3P29508 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SERPINB3P29508 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SERPINB3P29508 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SERPINB3P29508 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SERPINB3P29508 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SERPINB3P29508 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SERPINB3P29508 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SERPINB3P29508 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SERPINB3P29508 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SERPINB3P29508 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms