Protein–RNA interactions for Protein: P29017

CD1C, T-cell surface glycoprotein CD1c, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD1CP29017 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
CD1CP29017 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD1CP29017 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD1CP29017 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD1CP29017 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD1CP29017 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CD1CP29017 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CD1CP29017 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD1CP29017 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD1CP29017 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CD1CP29017 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD1CP29017 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CD1CP29017 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD1CP29017 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD1CP29017 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD1CP29017 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD1CP29017 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD1CP29017 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD1CP29017 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD1CP29017 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD1CP29017 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CD1CP29017 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD1CP29017 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD1CP29017 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD1CP29017 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD1CP29017 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD1CP29017 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD1CP29017 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD1CP29017 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD1CP29017 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD1CP29017 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD1CP29017 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD1CP29017 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD1CP29017 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD1CP29017 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD1CP29017 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD1CP29017 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD1CP29017 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD1CP29017 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD1CP29017 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD1CP29017 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD1CP29017 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD1CP29017 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD1CP29017 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD1CP29017 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CD1CP29017 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CD1CP29017 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD1CP29017 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD1CP29017 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD1CP29017 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD1CP29017 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD1CP29017 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD1CP29017 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD1CP29017 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD1CP29017 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD1CP29017 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD1CP29017 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD1CP29017 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD1CP29017 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD1CP29017 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD1CP29017 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD1CP29017 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CD1CP29017 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD1CP29017 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD1CP29017 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD1CP29017 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD1CP29017 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD1CP29017 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD1CP29017 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD1CP29017 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD1CP29017 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD1CP29017 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CD1CP29017 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CD1CP29017 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD1CP29017 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD1CP29017 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD1CP29017 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD1CP29017 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD1CP29017 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD1CP29017 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CD1CP29017 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD1CP29017 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD1CP29017 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD1CP29017 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD1CP29017 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD1CP29017 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD1CP29017 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD1CP29017 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD1CP29017 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD1CP29017 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD1CP29017 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD1CP29017 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD1CP29017 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD1CP29017 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD1CP29017 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD1CP29017 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD1CP29017 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD1CP29017 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD1CP29017 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD1CP29017 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms