Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HLA-DMAP28067 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HLA-DMAP28067 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HLA-DMAP28067 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
HLA-DMAP28067 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HLA-DMAP28067 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
HLA-DMAP28067 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HLA-DMAP28067 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HLA-DMAP28067 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HLA-DMAP28067 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
HLA-DMAP28067 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HLA-DMAP28067 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HLA-DMAP28067 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HLA-DMAP28067 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HLA-DMAP28067 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HLA-DMAP28067 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HLA-DMAP28067 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HLA-DMAP28067 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HLA-DMAP28067 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HLA-DMAP28067 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HLA-DMAP28067 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HLA-DMAP28067 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HLA-DMAP28067 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HLA-DMAP28067 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HLA-DMAP28067 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HLA-DMAP28067 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HLA-DMAP28067 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HLA-DMAP28067 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HLA-DMAP28067 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HLA-DMAP28067 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HLA-DMAP28067 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HLA-DMAP28067 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HLA-DMAP28067 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HLA-DMAP28067 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HLA-DMAP28067 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HLA-DMAP28067 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
HLA-DMAP28067 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
HLA-DMAP28067 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HLA-DMAP28067 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HLA-DMAP28067 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HLA-DMAP28067 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HLA-DMAP28067 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HLA-DMAP28067 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HLA-DMAP28067 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HLA-DMAP28067 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HLA-DMAP28067 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HLA-DMAP28067 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HLA-DMAP28067 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HLA-DMAP28067 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HLA-DMAP28067 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HLA-DMAP28067 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HLA-DMAP28067 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HLA-DMAP28067 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HLA-DMAP28067 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HLA-DMAP28067 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HLA-DMAP28067 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HLA-DMAP28067 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HLA-DMAP28067 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HLA-DMAP28067 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HLA-DMAP28067 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
HLA-DMAP28067 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HLA-DMAP28067 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HLA-DMAP28067 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HLA-DMAP28067 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HLA-DMAP28067 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HLA-DMAP28067 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HLA-DMAP28067 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
HLA-DMAP28067 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HLA-DMAP28067 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HLA-DMAP28067 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HLA-DMAP28067 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HLA-DMAP28067 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HLA-DMAP28067 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
HLA-DMAP28067 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HLA-DMAP28067 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HLA-DMAP28067 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HLA-DMAP28067 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HLA-DMAP28067 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HLA-DMAP28067 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
HLA-DMAP28067 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HLA-DMAP28067 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HLA-DMAP28067 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HLA-DMAP28067 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HLA-DMAP28067 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HLA-DMAP28067 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HLA-DMAP28067 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HLA-DMAP28067 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
HLA-DMAP28067 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HLA-DMAP28067 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HLA-DMAP28067 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HLA-DMAP28067 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HLA-DMAP28067 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HLA-DMAP28067 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HLA-DMAP28067 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HLA-DMAP28067 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HLA-DMAP28067 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HLA-DMAP28067 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HLA-DMAP28067 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
HLA-DMAP28067 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HLA-DMAP28067 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms