Protein–RNA interactions for Protein: P27694

RPA1, Replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA1P27694 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPA1P27694 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPA1P27694 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPA1P27694 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPA1P27694 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26■■□□□ 1.75
RPA1P27694 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RPA1P27694 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RPA1P27694 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
RPA1P27694 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RPA1P27694 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RPA1P27694 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RPA1P27694 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPA1P27694 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPA1P27694 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPA1P27694 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPA1P27694 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPA1P27694 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPA1P27694 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPA1P27694 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPA1P27694 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPA1P27694 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPA1P27694 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPA1P27694 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPA1P27694 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RPA1P27694 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RPA1P27694 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RPA1P27694 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RPA1P27694 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RPA1P27694 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RPA1P27694 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RPA1P27694 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RPA1P27694 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RPA1P27694 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RPA1P27694 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RPA1P27694 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RPA1P27694 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RPA1P27694 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
RPA1P27694 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RPA1P27694 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
RPA1P27694 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPA1P27694 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPA1P27694 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPA1P27694 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPA1P27694 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPA1P27694 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPA1P27694 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPA1P27694 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPA1P27694 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPA1P27694 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
RPA1P27694 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
RPA1P27694 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPA1P27694 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPA1P27694 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
RPA1P27694 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPA1P27694 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPA1P27694 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPA1P27694 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPA1P27694 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPA1P27694 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPA1P27694 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPA1P27694 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPA1P27694 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPA1P27694 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPA1P27694 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPA1P27694 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPA1P27694 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPA1P27694 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPA1P27694 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPA1P27694 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPA1P27694 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPA1P27694 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPA1P27694 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPA1P27694 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPA1P27694 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPA1P27694 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPA1P27694 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPA1P27694 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPA1P27694 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPA1P27694 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPA1P27694 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPA1P27694 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
RPA1P27694 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RPA1P27694 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RPA1P27694 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RPA1P27694 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RPA1P27694 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
RPA1P27694 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPA1P27694 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPA1P27694 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPA1P27694 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
RPA1P27694 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPA1P27694 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPA1P27694 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
RPA1P27694 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPA1P27694 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPA1P27694 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
RPA1P27694 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPA1P27694 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPA1P27694 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPA1P27694 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms