Protein–RNA interactions for Protein: P26373

RPL13, 60S ribosomal protein L13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL13P26373 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPL13P26373 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPL13P26373 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPL13P26373 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPL13P26373 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPL13P26373 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPL13P26373 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPL13P26373 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPL13P26373 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPL13P26373 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RPL13P26373 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPL13P26373 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPL13P26373 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPL13P26373 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPL13P26373 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPL13P26373 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPL13P26373 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPL13P26373 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPL13P26373 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPL13P26373 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPL13P26373 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPL13P26373 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPL13P26373 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPL13P26373 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPL13P26373 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RPL13P26373 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPL13P26373 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPL13P26373 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPL13P26373 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPL13P26373 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPL13P26373 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPL13P26373 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPL13P26373 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPL13P26373 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPL13P26373 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPL13P26373 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPL13P26373 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPL13P26373 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPL13P26373 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPL13P26373 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RPL13P26373 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RPL13P26373 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RPL13P26373 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RPL13P26373 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RPL13P26373 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPL13P26373 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPL13P26373 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPL13P26373 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPL13P26373 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPL13P26373 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPL13P26373 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPL13P26373 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPL13P26373 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPL13P26373 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPL13P26373 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPL13P26373 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPL13P26373 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPL13P26373 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPL13P26373 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPL13P26373 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPL13P26373 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPL13P26373 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPL13P26373 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPL13P26373 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPL13P26373 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPL13P26373 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPL13P26373 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPL13P26373 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPL13P26373 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPL13P26373 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPL13P26373 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPL13P26373 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPL13P26373 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPL13P26373 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPL13P26373 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RPL13P26373 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPL13P26373 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPL13P26373 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPL13P26373 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPL13P26373 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RPL13P26373 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPL13P26373 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPL13P26373 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPL13P26373 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPL13P26373 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPL13P26373 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPL13P26373 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RPL13P26373 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPL13P26373 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPL13P26373 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPL13P26373 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPL13P26373 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RPL13P26373 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPL13P26373 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPL13P26373 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPL13P26373 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPL13P26373 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPL13P26373 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RPL13P26373 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPL13P26373 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms