Protein–RNA interactions for Protein: P22694

PRKACB, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACBP22694 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRKACBP22694 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRKACBP22694 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRKACBP22694 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRKACBP22694 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRKACBP22694 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRKACBP22694 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRKACBP22694 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRKACBP22694 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRKACBP22694 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRKACBP22694 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRKACBP22694 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRKACBP22694 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRKACBP22694 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRKACBP22694 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRKACBP22694 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRKACBP22694 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRKACBP22694 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRKACBP22694 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PRKACBP22694 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRKACBP22694 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRKACBP22694 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PRKACBP22694 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRKACBP22694 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRKACBP22694 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRKACBP22694 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRKACBP22694 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRKACBP22694 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRKACBP22694 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRKACBP22694 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRKACBP22694 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRKACBP22694 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PRKACBP22694 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRKACBP22694 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRKACBP22694 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRKACBP22694 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRKACBP22694 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKACBP22694 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKACBP22694 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKACBP22694 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKACBP22694 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKACBP22694 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKACBP22694 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKACBP22694 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKACBP22694 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKACBP22694 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKACBP22694 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKACBP22694 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKACBP22694 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKACBP22694 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKACBP22694 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKACBP22694 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKACBP22694 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKACBP22694 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKACBP22694 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKACBP22694 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKACBP22694 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKACBP22694 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKACBP22694 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKACBP22694 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKACBP22694 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKACBP22694 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKACBP22694 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKACBP22694 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKACBP22694 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKACBP22694 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKACBP22694 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKACBP22694 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKACBP22694 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKACBP22694 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKACBP22694 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKACBP22694 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKACBP22694 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKACBP22694 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKACBP22694 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKACBP22694 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKACBP22694 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKACBP22694 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKACBP22694 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKACBP22694 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKACBP22694 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKACBP22694 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKACBP22694 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKACBP22694 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKACBP22694 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKACBP22694 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKACBP22694 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKACBP22694 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKACBP22694 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKACBP22694 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKACBP22694 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKACBP22694 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKACBP22694 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKACBP22694 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKACBP22694 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKACBP22694 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKACBP22694 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKACBP22694 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKACBP22694 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKACBP22694 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms